주요 차이 stbr green과 taqman 사이에는 sybr green은 PCR 반응 동안 축적 된 PCR 생성물을 검출하는 데 사용되는 dsDNA 결합 염료 인 반면 는 입니다. Taqman 은 입니다 형광성 PCR 동안 축적되는 표적 유전자에 특이적인 프로브. 또한, Sybr Green은 중간 특이성을 가지며 Taqman은 특이성이 높습니다. 또한, Sybr Green의 재현성은 또한 중간이며 Taqman의 재현성은 높습니다.
sybr green과 taqman은 실시간 PCR 절차에서 PCR 제품을 탐지하는 데 사용되는 두 가지 화학입니다.
주요 영역을 다루었습니다
1. sybr green
- 정의, 화학, 중요성
2. Taqman이란 무엇입니까
- 정의, 화학, 중요성
3. Sybr Green과 Taqman 의 유사점은 무엇입니까?
- 일반적인 기능의 개요
4. Sybr Green과 Taqman의 차이점은 무엇입니까
- 주요 차이의 비교
주요 용어
제품의 검출, 실시간 PCR, Sybr Green, Taqman Probes
sybr green
sybr green은 분자 생물학에서 DNA 및 RNA를 염색하는 데 사용되는 dsDNA 결합 염료입니다. 일반적으로 실시간 PCR의 생성물을 감지하는 데 사용됩니다. PCR의 진행 동안, SYBR 녹색은 새로 증폭되는 각각의 PCR 생성물에 결합한다. 따라서 PCR의 끝에서 형성된 생성물의 양은 샘플의 형광 강도에 비례합니다.
그림 1 :Sybr Green Chemistry
또한 Sybr Green의 주요 장점은 임의의 이중 가닥 DNA 서열의 증폭을 모니터링 할 수 있다는 것입니다. 그러나 이것은 반면에, 허위 양성 신호를 생성함으로써 분석의 특이성을 감소시킨다. 프로브의 사용을 제거하여 분석 비용을 줄입니다. 또한 Sybr Green의 사용은 기술적으로 쉬운 프로세스입니다. 한편, 단일 PCR 생성물에 다중 염료를 결합하면 검출의 감도가 증가한다.
Taqman
taqman은 형광이 표시되고 구체적으로 실시간 PCR에서 대상 PCR 생성물에 결합합니다. 따라서 특정 PCR 분석을 감지하기 위해 특정 프로브를 설계해야합니다. 따라서, Taqman 프로브의 주요 장점은 목표-특이 적 혼성화입니다. 또한, 상이하고 구별 가능한 리포터 염료로 표지 된 프로브를 사용하면 하나의 반응 튜브에서 2 개의 별개의 서열을 검출 할 수 있습니다.
그림 2 :Taqman Probe Chemistry
일반적으로 Taqman 프로브는 5 '말단에 형광성 리포터 염료와 3'말단에 Quencher 염료가있는 올리고 뉴클레오티드 프로브입니다. 프로브가 손상되지 않으면, 켄퍼 염료의 근접성은 형광 공명 에너지 전달 (FRET)에 의해 리포터 염료에 의해 방출되는 형광을 크게 감소시킨다. 그러나, 프로브가 프라이머 부위 중 하나로부터 하류로 표적 서열에 어닐링 될 때, 5 'taq 의 5'뉴 클레아 제 활성. DNA 폴리머 라제는 프라이머 연장 동안 프로브의 5 '말단을 절단한다. 따라서, 이것은 리포터 염료를 Quencher 염료로부터 분리하여 리포터 염료 신호를 증가시킨다.
Sybr Green과 Taqman의 유사성
- sybr green 및 taqman은 실시간 PCR에서 PCR 제품의 검출의 두 가지 화학입니다.
- 둘 다 실시간으로 PCR 제품에 결합합니다.
- 각 PCR주기에서 PCR 생성물을 정량화하는 데 도움이됩니다.
- 유전자 발현 분석, DNA 정량화, ChIP (Chromatin Immuneprecipitation) 등 에 중요합니다.
Sybr Green과 Taqman의 차이
정의
sybr green은 분자 생물학에서 핵산 염색으로 사용되는 비대칭 시아닌 염료를 말하며 Taqman은 양적 PCR의 특이성을 증가 시키도록 설계된 프로브를 참조합니다.
의 중요성
또한, Sybr Green은 PCR 반응 동안 축적되는 PCR 생성물을 검출하는 데 사용되는 dsDNA 결합 염료이며, Taqman은 PCR 동안 축적되는 표적 유전자에 특이적인 형광성 프로브입니다. 따라서 이것은 Sybr Green과 Taqman의 주요 차이점입니다.
감지 유형
또한 Sybr Green은 시퀀스 특이성없이 실시간 PCR 제품을 감지하는 데 사용될 수 있지만 Taqman 프로브는 서열 특이 적 방식으로 PCR 제품 만 감지합니다.
디자인
sybr green은 사전 디자인 할 필요가 없지만 특정 PCR 제품의 검출을 위해 Taqman이 사전 디자인해야합니다.
최적화
또한 Sybr Green은 특정 실시간 PCR에 대해 최적화되어야하지만 Taqman은 최적화 할 필요가 없습니다.
특이성
sybr green과 taqman의 또 다른 차이점은 Sybr Green의 중간 특이성을 가지고 있고 Taqman은 특이성이 높다는 것입니다.
감도
sybr green의 감도는 가변적이며 Taqman의 감도는 최대 1-10 부입니다.
PCR 억제
sybr green은 PCR 반응을 어느 정도 억제 할 수 있지만 Taqman은 PCR 반응을 억제하지 않습니다.
재현성
sybr green의 재현성은 중간 정도이며 Taqman의 재현성은 높습니다.
멀티플렉싱
또한 Sybr Green은 다중화에 사용할 수 없으며 Taqman은 동일한 샘플에서 여러 PCR 제품을 감지 할 수 있습니다.
응용
sybr green은 유전자 발현 분석, 병원체 검출의 DNA 정량 등에 중요합니다. Taqman은 SNP 유전자형 분석에 중요하지만 돌연변이, 단백질 분석 등과 같은 카피 수 변이의 탐지
결론
간단히 말해서, sybr green은 실시간 PCR에서 PCR 생성물을 검출하는 데 사용되는 dsDNA 결합 염료입니다. 일반적으로, 비특이적 방식으로 샘플의 모든 PCR 생성물에 결합합니다. 따라서 특이성은 중간입니다. 한편, Taqman은 형광-표지 프로브이며, 특히 샘플에서 특정 PCR 생성물에 결합된다. 따라서 이러한 프로브는 샘플 유형에 따라 다릅니다. 또한, 이것은 분석에 높은 특이성을 제공합니다. 따라서 Sybr Green과 Taqman의 주요 차이점은 화학과 장점입니다.
참조 :
1.“Taqman vs Sybr Chemistry.” Thermo Fisher Scientific , Thermo Fisher Scientific - 미국, 여기에서 제공됩니다.
이미지 제공 :
1. "Sybr green with sybr green"-– Gygonaar 23:09, 2006 년 3 월 7 일 (UTC)-Commons Wikimedia
2를 통해 PowerPoint (CC By-SA 3.0)로 Ygonaar가 작성하는 그래프입니다. 사용자의 "Taqman":BrainDamaged - Commons Wikimedia를 통해 원래 업로더 (Public Domain)의 자신의 작업
