* 크기 : 미토콘드리아는 매우 작은 소기관이며, 일반적으로 길이가 몇 마이크로 미터를 측정합니다. 광학 현미경에는 이러한 작은 구조물을 시각화하기위한 해상도가 없습니다.
* 내부 구조 : TEM은 Cristae (접힌 막) 및 매트릭스를 포함하여 미토콘드리아의 내부 구조를 시각화 할 수 있습니다. 이 세부 수준은 미토콘드리아 기능을 이해하는 데 중요합니다.
* 전자 염색 : TEM은 중금속 얼룩을 사용하여 미토콘드리아의 대비를 향상시켜 세포의 배경에 대해 쉽게 볼 수 있습니다.
광학 현미경은 효모 세포를 관찰하는 데 사용될 수 있지만 미토콘드리아와 같은 내부 소기관의 세부 사항을 밝히지 않습니다.