1 차 구조 :단백질의 골격
1 차 구조 단백질의 아미노산의 선형 서열을 지칭한다. 그것은 폴리펩티드 사슬을 구성합니다. 이 서열은 단백질의 알파벳과 같으며 전체 모양, 기능 및 상호 작용을 지시합니다.
단백질을 긴 구슬 사슬로 상상해보십시오. 각 비드는 아미노산을 나타냅니다. 기본 구조는 어떤 구슬이 어떤 것인지, 어떤 순서로 연결되어 있는지 알려줍니다.
실험실 공제 :
단백질의 주요 구조를 결정하는 데 몇 가지 단계가 필요합니다.
1. 단백질 정제 : 먼저, 관심 단백질은 주변 혼합물 (예를 들어, 세포, 조직)으로부터 분리되어야한다. 여기에는 종종 크로마토 그래피, 전기 영동 및 원심 분리와 같은 기술이 포함됩니다.
2. 단백질 소화 : 이어서, 정제 된 단백질은 프로테아제 (예를 들어, 트립신, 키모 트립신)를 사용하여 효소 소화에 의해 작은 단편으로 분해된다. 이들 효소는 특정 아미노산 잔기에서 폴리펩티드 사슬을 절단하여 펩티드의 혼합물을 생성한다.
3. 펩티드 분리 및 식별 : 이어서, 생성 된 펩티드는 고성능 액체 크로마토 그래피 (HPLC) 또는 전기 영동과 같은 기술을 사용하여 분리된다. 이어서, 각각의 펩티드 단편은 질량 분석법을 사용하여 서열 분석된다 . 질량 분석법은 개별 펩티드의 질량 대 하전 비율을 측정하여 식별 및 시퀀싱을 허용합니다.
4. 시퀀스 정렬 : 이어서, 개별 펩티드의 서열은 원래의 단백질의 완전한 아미노산 서열을 재구성하기 위해 정렬된다. 이 과정은 펩티드 서열을 겹치고 사용 된 프로테아제의 알려진 절단 부위를 고려하는 것을 포함한다.
5. DNA 시퀀싱에 대한 확인 : 추론 된 단백질 서열의 정확도를 확인하기 위해, 단백질을 암호화하는 상응하는 DNA 서열을 측정 할 수있다. 이것은 표준 DNA 시퀀싱 기술을 사용하여 달성 할 수 있습니다.
도구 및 기술 :
* Edman 열화 : 단백질의 N- 말단 아미노산을 측정하는 고전적인 방법. 여기에는 N- 말단에서 아미노산의 단계적 제거 및 식별이 포함됩니다. 그러나,이 방법은 비교적 짧은 펩티드로 제한된다.
* 질량 분석법 : 현대 질량 분석법 기술은 매우 정확하고 민감하며 펩티드의 복잡한 혼합물을 분석 할 수 있습니다.
* 생물 정보학 도구 : 소프트웨어 프로그램 및 데이터베이스를 사용하여 단백질 서열을 분석하고, 잠재적 변형을 식별하며, 단백질 기능을 예측할 수 있습니다.
1 차 구조의 중요성 :
단백질의 주요 구조를 아는 것은 다음을 이해하는 데 중요합니다.
* 기능 : 서열은 단백질이 다른 분자와 접고 상호 작용하는 방법을 지시한다.
* 구조 : 이 서열은 단백질의 3 차원 모양을 결정하며, 이는 활성에 필수적이다.
* 진화 : 다른 종의 단백질 서열을 비교하면 진화 관계를 나타내고 보존 된 기능적 영역을 식별 할 수 있습니다.
결론적으로, 단백질의 주요 구조를 결정하는 것은 기본 특성을 이해하기위한 복잡하지만 필수적인 과정이다. 단백질 구조, 기능 및 진화에 대한 추가 조사를위한 토대를 제공합니다.
