1. 시퀀스 비교 :
* 전체 게놈 시퀀싱 : 이 방법은 각 유기체의 완전한 DNA 서열을 결정합니다. 서열을 비교하면 유전자 함량, 순서 및 단일 염기 변동 (SNP)의 차이가 나타납니다.
* 표적화 된 시퀀싱 : 관심있는 유전자와 같은 게놈의 특정 영역에 초점을 맞추는 것은보다 비용 효율적이며 특정 차이에 대한 통찰력을 제공 할 수 있습니다.
* DNA 지문 : 제한 단편 길이 다형성 (RFLP) 또는 짧은 탠덤 반복 (STR) 분석과 같은 기술을 사용하여 특정 DNA 패턴이 생성되고 비교됩니다. 이것은 특정 DNA 세그먼트의 수와 길이의 차이를 보여줄 수 있습니다.
2. 물리적 특성 :
* 베이스 구성 : 각각의 뉴클레오티드 (A, T, C, G)의 상대적 풍부는 유기체마다 다릅니다. 이것은 분광 광도법 또는 크로마토 그래피와 같은 기술을 사용하여 분석 할 수 있습니다.
* 용융 온도 (TM) : DNA 가닥이 분리되는 온도는 기본 조성에 의해 영향을받습니다. TM의 차이는 DNA 서열의 차이를 나타낼 수있다.
* 분자량 : 다른 유기체의 DNA는 유사한 구조를 공유 할 수 있지만, 게놈 크기의 변화로 인해 전체 크기와 체중이 다를 수 있습니다.
3. 기능 분석 :
* 유전자 발현 분석 : 특정 유전자의 활성을 비교하면 유기체가 DNA를 사용하는 방식의 차이를 드러 낼 수 있습니다. RNA 시퀀싱 (RNA-Seq) 또는 마이크로 어레이와 같은 기술 이이 목적을 위해 사용됩니다.
* 단백질 분석 : DNA에 의해 인코딩 된 단백질은 궁극적으로 유기체의 특성을 결정합니다. 전기 영동 또는 질량 분석법과 같은 기술을 통해 단백질 프로파일을 비교하면 유전자 발현 및 기능의 차이를 확인할 수 있습니다.
4. 계통 발생 학적 분석 :
* 비교 유전체학 : DNA 서열을 비교하여 유기체 간의 진화 관계를 조사합니다. 이것은 공통의 조상과 진화 경로를 드러낼 수 있습니다.
* 계통 발생 나무 구조 : 서열 유사성 및 차이에 기초하여, 유기체 간의 진화 관계를 시각화하기 위해 계통 발생 트리를 생성 할 수있다.
적절한 방법을 선택하는 것은 특정 연구 질문과 이용 가능한 자원에 따라 다릅니다. 각 접근법은 두 유기체의 DNA의 차이점에 대한 독특한 통찰력을 제공합니다.
