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계통 발생 수의 숫자는 무엇을 의미합니까?

계통 발생 트리의 숫자는 특정 나무와 구조 방법에 따라 다른 의미를 가질 수 있습니다. 몇 가지 일반적인 해석은 다음과 같습니다.

1. 분기 길이 :

* 진화 시간에 비례 : 일부 나무에서, 가지 길이는 두 계통의 발산 이후 통과 된 추정 된 진화 시간을 나타냅니다. 더 긴 지점은 더 많은 시간이 경과했음을 나타냅니다.

* 유전자 거리에 비례 : 다른 나무에서, 가지 길이는 종 사이의 유전 적 거리에 비례합니다. 가지가 길수록 종의 종들 사이의 유전 적 차이가 커집니다.

* 임의 : 일부 나무는 가지 길이를 사용하여 시간이나 유전 적 거리를 나타내지 않고 종 간의 관계를 단순히 묘사합니다.

2. 부트 스트랩 지원 값 :

* 노드 배치에 대한 신뢰 : 부트 스트랩 값은 임의로 리 샘플링 된 데이터 세트에서 특정 노드 (브랜치 포인트)가 발견 된 시간의 백분율을 나타냅니다. 값이 높을수록 해당 노드의 배치에 대한 신뢰도가 높아집니다.

* 예 : 95%의 부트 스트랩 값은 노드가 리 샘플링 된 데이터 세트의 95%에서 발견되었음을 의미하며, 이는 그 존재에 대한 강력한 통계적 지원을 시사합니다.

3. 후방 확률 :

* 베이지안 추론 : 베이지안 추론을 사용하여 생성 된 나무에서, 후방 확률은 데이터를 고려할 때 특정 노드가 정확할 확률을 나타냅니다.

* 예 : 0.95의 후방 확률은 노드가 올바르게 배치 될 확률이 95%임을 의미합니다.

4. 노드 레이블 :

* 종 이름 : 때로는 숫자가 특히 많은 수의 종을 다룰 때 특정 노드를 표시하는 데 사용됩니다.

* 기타 정보 : 노드 레이블은 또한 종의 지질 학적 연령 또는 특정 화석의 이름과 같은 다른 정보를 나타낼 수 있습니다.

5. 스케일 바 :

* 시간/유전 적 변화 단위 : 스케일 막대는 종종 계통 발생 트리에 포함되어 분지 길이로 표시되는 시간 또는 유전 적 변화를 나타냅니다.

특정 계통 발생 나무에서 숫자의 의미를 이해하려면 다음과 같은 것이 중요합니다.

* 그림 전설을 읽으십시오 : 이것은 종종 나무에 사용 된 숫자와 다른 기호의 의미를 설명합니다.

* 나무 구조 방법을 고려하십시오 : 다른 방법 (예 :parsimony, 거리, 베이지안)은 다른 유형의 숫자를 사용할 수 있습니다.

* 원래 출판물을 참조하십시오 : 과학 논문에서 나무를 검사하는 경우 저자는 일반적으로 방법 섹션의 숫자의 의미를 설명합니다.

이러한 세부 사항에주의를 기울임으로써 계통 발생 트리에 제시된 정보를 해석하고 종과 다각화로 이어진 진화 사건 사이의 관계를 이해할 수 있습니다.

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