프로브와 프라이머의 차이

주요 차이 - 프로브 대 프라이머

PCR은 생명 공학에서 특정 DNA 단편을 다양한 목적으로 증폭시키는 데 사용되는 기술입니다. 프로브 및 프라이머는 다양한 유형의 PCR에 사용되는 두 가지 유형의 단일 가닥 올리고 뉴클레오티드입니다. 프로브는 주로 QPCR에 사용되며 합성 프라이머는 모든 유형의 PCR에 사용됩니다. 주요 차이 프로브와 프라이머 사이는 프로브가 프로브는 이중 가닥 DNA와의 혼성화를 통해 혼합물에서 특정 DNA 단편의 존재를 검출하는데 사용되는 반면, 프라이머는 단일 가닥 DNA 에 의한 폴리머 라제 연쇄 반응의 개시에 사용된다. . 일반적으로, 프라이머는 세포 내부의 DNA 복제 개시에 사용된다. 프로브는 혼성화 반응에도 사용됩니다.

주요 영역을 다루었습니다

1. 프로브는 무엇입니까
- 정의, 디자인, 중요성
2. 프라이머는 무엇입니까
- 정의, 디자인, 중요성
3. 프로브와 프라이머의 유사점은 무엇입니까
- 일반적인 기능의 개요
4. 프로브와 프라이머의 차이점은 무엇입니까
- 주요 차이점 비교

주요 용어 :혼성화, 올리고 뉴클레오티드, PCR, 프라이머, 프로브, QPCR

프로브

프로브는 샘플 내에서 특정 DNA 단편의 존재를 검출하는 데 사용되는 DNA 또는 RNA의 단편입니다. 따라서, 프로브는 QPCR 및 하이브리드 화 반응에서 두 가지 유형의 기술에 사용될 수 있습니다. 프로브 설계에서 네 가지 사실을 고려해야합니다.

1. 위치 - 프로브는 역방향 또는 전방 프라이머에 근접하여 DNA 가닥과 혼성화해야합니다. 그러나 프라이머 바인딩 부위와 겹쳐서는 안됩니다. 일반적으로, DNA 이중의 가닥으로 하이브리드 화.
.
2. 녹는 온도 (TM) -프로브의 용융 온도는 프라이머의 용융 온도보다 6-8 ° C 높아야합니다.
3. 어닐링 온도 (TA) - 실험의 어닐링 온도는 프라이머의 용융 온도보다 5 ° C이어야합니다.
4. gc 컨텐츠 -프로브의 GC 함량은 35-65%여야합니다. 프로브의 5 ′ 끝에는 g.
가 포함되어서는 안됩니다.

qpcr에서 프로브에는 형광 염료 또는 방사성 요소가 표시됩니다. 이들 프로브는 DNA 듀플렉스에서 표적 서열과 혼성화된다. 방사성 요소 또는 형광을 갖는 다양한 유형의 표지 된 프로브가 다양한 유형의 하이브리드 화 반응에도 사용됩니다. 표적 서열에 대한 PNA 프로브의 혼성화는 도 1 에 도시되어있다. . PNA 프로브는 텔로미어의 길이를 결정하는 데 사용됩니다.

그림 1 :PNA 프로브의 혼성화

혼성화 중에 프로브는 보완적인 방식으로 단일 가닥 DNA에 결합합니다. 

프라이머

프라이머는 DNA 합성의 출발점으로서 작용하는 짧은 DNA 또는 RNA가 있습니다. RNA 프라이머는 세포 내부에서 DNA 폴리머 라제의 도움으로 DNA 복제를 개시하기 위해 사용된다. 합성 DNA 프라이머는 주로 PCR에 사용하여 원하는 DNA 단편을 증폭시킨다. 표적 서열은 전방 프라이머 및 리버스 프라이머로 알려진 2 개의 프라이머에 의해 측면에있다. 특이성 및 상보성 프라이머 설계의 주요 요인입니다. 2 차 구조도 피해야합니다. 프라이머 설계 중에 고려해야 할 다른 요인은 다음과 같습니다.

1. 녹는 온도 (TM) -전방 및 리버스 프라이머의 최적 용융 온도는 60-64 ° C 여야합니다.
2. 어닐링 온도 - 실험의 어닐링 온도는 각 프라이머의 용융 온도보다 5 ° C이어야합니다.
3. gc 컨텐츠 -프라이머의 GC 함량은 35-65%여야합니다.

표적 DNA의 두 가닥으로의 전방 및 리버스 프라이머의 어닐링은 그림 2에 나와 있습니다.

그림 2 :프라이머 어닐링

DNA 시퀀싱에서 프라이머는 표적 단편의 증폭에 사용됩니다. 프라이머는 다양한 검출 목적으로 방사성 요소 또는 형광으로 표지 될 수 있습니다. 

프로브와 프라이머 간의 유사성

• 프로브와 프라이머는 다양한 PCR 기술에 사용되는 두 가지 유형의 단일 가닥 올리고 뉴클레오티드입니다.
• 프로브와 프라이머는 모두 특정 DNA 단편에 특화되어 있습니다.
• 프로브와 프라이머는 DNA/RNA 일 수 있습니다.
• 프로브와 프라이머는 목표 시퀀스와 함께 어닐링 할 특정 온도가 있습니다.
• 프로브와 프라이머는 검출을 위해 형광 단을 얽힐 수 있습니다.

프로브와 프라이머의 차이

정의

프로브 : 프로브는 샘플 내에서 특정 DNA 단편의 존재를 검출하는 데 사용되는 DNA 또는 RNA의 단편입니다.

프라이머 : 프라이머는 DNA 합성의 출발점으로 작용하는 짧은 DNA 또는 RNA 가닥입니다.

역할

프로브 : 프로브는 QPCR에서 특정 DNA 단편을 감지하는 데 사용됩니다.

프라이머 : 프라이머는 DNA 복제를 시작하는 데 사용됩니다. PCR의 시작에도 사용됩니다.

길이

프로브 : 프로브의 길이는 25-1000 기본 쌍의 범위입니다.

프라이머 : 프라이머의 길이는 18-22 기본 쌍입니다.

혼성화

프로브 : 프로브는 이중 가닥 DNA로 혼성화됩니다.

프라이머 : 프라이머는 단일 가닥 DNA로 혼성화됩니다.

라벨링

프로브 : 프로브는 일반적으로 검출을 위해 형광 단으로 표시됩니다.

프라이머 : 프라이머는 목적에 따라 라벨을 붙일 수 있습니다.

결론

프로브와 프라이머는 다양한 유형의 PCR에 사용되는 단일 가닥 올리고 뉴클레오티드의 두 가지 유형입니다. 프로브는 QPCR에서 특정 DNA 단편의 검출에 사용된다. 프라이머는 세포 내부에서 DNA 복제를 개시하는 데 사용되며 PCR의 개시에도 사용됩니다. 따라서 프로브와 프라이머의 주요 차이점은 그들의 목적입니다.

참조 :

1. PCR 프라이머 및 프로브 설계 , 통합 DNA 기술, 여기에서 구할 수 있습니다.

이미지 제공 :

1. Commons Wikimedia
2를 통해 English Wikipedia (CC x 3.0)의 JCLAM의“Q-Fish Workflow”. Richard Wheeler (Zephyris)의 "Primers Revcomp Longation"-Commons Wikimedia를 통해 자신의 작업 (CC By-SA 3.0)