프로테오믹스와 전 사체의 차이

proteomics and transcriptomics는 특정 유기체의 유전자 발현이 연구되는 두 가지 영역입니다.

주요 영역을 다루었습니다

1. Proteomics
- 정의, 사실, 응용 프로그램
2. 전 사체 가란?
- 정의, 사실, 응용 프로그램
3. 프로테오믹스와 전 사체학의 유사점은 무엇입니까
- 공통 기능의 개요
4. 프로테오믹스와 전 사체학의 차이점은 무엇입니까
- 주요 차이점 비교

주요 용어

적용, mRNA, 단백질, 단백질 학, 기술, 전 사체학

단백질체

proteomics는 단백질체에 대한 대규모 연구입니다. 프로테옴은 특정 유기체 또는 세포에 의해 생성 된 전체 단백질 세트를 지칭한다. 따라서, 특정 유형의 유기체 또는 세포는 독특한 프로테옴을 갖는다. 프로테오믹스의 주요 조사 영역은 다음과 같습니다.

• 단백질의 3D 구조 예측;
• 단백질 합성의 위치 및 시간 검출;
• 단백질 생산, 분해 및 정상 상태 풍부;
• 번역 후 변형과 같은 단백질 변형;
• 하위 세포 구획 사이의 단백질 수송;
• 대사 경로에서 단백질의 관여;
• 단백질의 서로 상호 작용.

  그림 1 :PDB에서 이용할 수있는 단백질 구조의 예

질량 분광법 및 겔 전기 영동 (Dige)의 차이와 같은 여러 고 처리량 기술이 단백질 연구에 관여합니다.

전 사체 가란 무엇인가

transcriptomics는 특정 유기체 또는 세포의 전 사체에 대한 연구입니다. 전 사체는 유기체 또는 세포의 전체 mRNA 세트를 지칭한다. 그러나 때로는 전체 RNA 세트를 지칭합니다. 전 사체는 유기체 또는 세포가 직면 해야하는 환경 조건에 따라 다릅니다. 따라서, 주어진 조건 세트 하에서 정의 된 시간으로 발현 된 RNA 세트를 반영한다. 전 사체에는 발현 프로파일 링 및 슬라이스 변형 분석의 조사가 포함됩니다. DNA 마이크로 어레이와 RNA SEQ는 전 사체에 사용되는 두 가지 주요 기술입니다.

그림 2 :마이크로 어레이 및 RNA SEQ

단백질체와 전 사체의 유사성

• Proteomics and Transcriptomics는 특정 유기체 또는 세포의 유형의 유전자 발현을 연구하는 두 가지 유형의 분야입니다.
• 높은 처리량 기술은 프로테오믹스와 전 사체에서 사용됩니다.

단백질체와 전 사체의 차이

정의

프로테오믹스는 단백질체와 그 기능에 대한 연구를 지칭하는 반면, 전 사체는 전 사체와 그 기능에 대한 연구를 지칭합니다.

연구 유형

proteomics 연구 전체 단백질 세트를 표현하는 동안 전 사체학은 특정 유기체에서 표현 된 mRNA의 전체 세트를 연구합니다.

현상

Proteomics는 단백질의 3D 구조와 기능을 연구하고 단백질-단백질 상호 작용을 연구하는 동안 전 사체학은 서열 구조, 환경과의 상호 작용 및 mRNA의 응용을 연구합니다.

기술

proteomics는 질량 분광법과 차이 겔 전기 영동 (dige)을 포함하는 반면, 전 사체학은 DNA 마이크로 어레이와 RNA seq를 기술로 포함합니다.

중요한 영역

프로테오믹스의 중요한 영역 중 일부는 컴퓨터 보조 약물 설계를위한 스위스 -2DPAGE 및 소프트웨어 개발과 같은 프로테옴 데이터베이스 개발이며, 전 사체학은 세포 분화, 발암 성, 분자 메커니즘 및 신호 전달 경로에 대한 연구에 포함됩니다. 개인.

결론

proteomics는 특정 유기체의 전체 단백질 세트에 대한 연구이며, 전 사체는 유기체의 전체 mRNA 세트에 대한 연구입니다. 따라서 프로테오믹스와 전 사체의 주요 차이점은 연구 유형입니다.

참조 :

1.“프로테오믹스 란 무엇입니까?” Proteomics :2016 년 6 월 8 일, EMBL-EBI 자원 소개, 여기에서 제공
2. Lowe, Rohan et al. "Transcriptomics Technologies." PLOS 계산 생물학 13.5 (2017) :E1005457. PMC. 편물. 2018 년 7 월 10 일, 여기에서 사용할 수 있습니다

이미지 제공 :

1. Axel Griewel의“단백질 구조 예”-Commons Wikimedia
2를 통한 자신의 작업 (CC By-SA 3.0). Thomas Shafee의“Microarray 및 시퀀싱 유량 셀” - Commons Wikimedia를 통한 Own Work (CC x 4.0)