siRNA와 shRNA의 차이점은 무엇입니까?

작은 간섭 RNA (siRNA)와 짧은 헤어 핀 RNA (shRNA)는 RNA 간섭 경로의 침묵 경로에 관여하는 두 가지 유형의 조절 RNA이며, 이는 표적 mRNA의 보완 적 결합에 따라 서열-특이 적 방식에서 표적 mRNA의 분해를 초래한다.

주요 영역을 다루었습니다

1. siRNA
- 정의, 구조, RNAI의 역할
2. shrna
- 정의, 구조, RNAI의 역할
3. siRNA와 shRNA의 유사점은 무엇입니까
- 일반적인 기능의 개요
4. siRNA와 shRNA의 차이점은 무엇입니까
- 주요 차이점 비교

주요 용어

siRNA, shRNA, 조절 RNA, RNAI, 서열-특이 적 분해, 표적 mRNA

siRNA

작은 간섭 RNA 또는 siRNA는 크기가 작은 이중 가닥 RNA 분자의 한 유형이며; 길이는 약 21 내지 25 뉴클레오티드. 유전자 침묵을 위해 이중 가닥 RNA의 형성을 사용하는 RNA 간섭 (RNAI) 경로에 대한 주요 접근법 중 하나입니다. 일반적으로, RNAI 경로는 유전자 발현의 전사 후 조절로서 단백질의 녹다운을 담당한다.

그림 1 :RNAI 경로의 siRNA

또한 긴 RNA 듀플렉스의 절단은 siRNA의 형성을 초래합니다. 여기서, dsRNA- 특이 적 RNase III 효소 인 dicer는 이중 가닥 RNA와 복합체를 형성한다. 이 효소는 dsRNA를 siRNA로 절단하여 3 '말단에 2 개의 뉴클레오티드의 돌출부를 남깁니다. 그 후, 이들 siRNA는 RNA 이중으로부터의 감지 가닥의 분해를 담당하는 RISC (RNA- 유도 된 침묵 복합체)와 복합체를 형성한다.

shrna

짧은 헤어핀 RNA 또는 shRNA는 헤어핀 루프를 형성하는 영역을 갖는 비교적 긴 RNA 분자의 한 유형이다. 일반적으로, shRNA는 벡터를 통해 세포에 상응하는 RNA 유전자를 도입하여 세포 내부에 형성된 인공 분자이다. 실제로, 그것은 세포 내부에서 자연스럽게 RNA 이중화의 형성에 관여하는 miRNA 분자를 모방합니다.

그림 2 :shrna 형성

또한, shRNA의 줄기 영역은 표적 mRNA 분자와의 혼성화에 의해 형성된다. 듀플렉스를 형성 한 후, dicer는 복합체에 결합하여 듀플렉스를 siRNA 분자로 절단한다. 이 siRNA 분자는 RISC와 결합하고 위에서 언급 한 것과 같은 방식으로 감각 가닥을 분해합니다.

siRNA와 shRNA 사이의 유사성

• siRNA와 shRNA는 비 코딩 및 조절 인 두 가지 유형의 작은 RNA입니다.
• 또한, RNA 유전자는 이들 RNA를 인코딩한다.
• 또한, 두 유형의 RNA는 표적 mRNA와 이중 가닥 RNA를 형성하여 RNA 간섭 경로를 유도 할 수있다.
.
• 그들은 셀 내부에서 Dicer와 RISC에 의해 처리됩니다.
• miRNA와 함께, 그들은 표적 mRNA의 서열-특이 적 분해를 담당한다.
• 따라서, 이들 RNA의 주요 기능은 유전자 발현의 전사 후 조절 인 RNA 침묵에 관여하는 것이다.
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siRNA와 shRNA의 차이

정의

siRNA는 이중 가닥 RNA의 절단 및 처리에 의해 생성 된 단일 가닥 RNA 분자를 지칭하는 반면, shRNA는 단단한 헤어핀 회전을 만들고 유전자 발현을 침묵 시키는데 사용될 수있는 짧은 RNA 서열의 RNA를 지칭한다. 따라서 이것은 siRNA와 shRNA의 주요 차이점입니다.

은

siRNA는 작은 간섭 RNA를 나타내며 shRNA는 짧은 헤어핀 RNA를 나타냅니다.

자연 또는 인공

또한, siRNA와 shRNA의 중요한 차이점은 siRNA가 자연적으로 세포에서 생성되는 반면, ShRNA는 변형을 통해 상응하는 RNA 유전자를 인공적으로 생성함으로써 세포에서 생성된다는 것이다.

구조

또한, siRNA는 길이가 21 ~ 25 개의 뉴클레오티드는 이중 가닥 RNA 분자이며, shRNA의 길이는 약 80 개의 염기 쌍이며 내부 혼성화 영역을 포함하여 헤어 핀 구조를 생성합니다. 따라서 이것은 또한 siRNA와 shRNA의 차이입니다.

길이

또한 siRNA와 shRNA의 또 다른 차이점은 siRNA가 짧고 shRNA가 비교적 길다는 것입니다.

역할

게다가, siRNA는 2 개의 뉴클레오티드의 3 인치 끝 돌출과 함께 dsRNA를 형성하며, 이는 RNA 간섭 (RNAI)을 활성화시키는 반면 shRNA는 siRNA로 처리되는 루프 구조를 함유한다.

miRNA와의 관계

또한 miRNA와의 관계는 siRNA와 shRNA의 차이도 있습니다. shRNA는 miRNA를 모방하는 반면, dicer 또는 drosha 단백질에 의해 miRNA의 처리에 의해 생성된다.

지속 가능성

shran은 선량 당 효과를 통해 일시적이며 shrna는 더 지속 가능합니다.

유효 용량

siRNA는 고용량에서 효과적이며 shRNA는 저용량으로 효과적입니다.

효능

힘은 siRNA와 shRNA의 또 다른 차이점입니다. shrna는 효능이 낮고 shrna는 효능이 낮습니다.

장점

siRNA의 제조 과정은 간단하지만 최적화 된 shRNA

응용

또한, siRNA는 표적에 대한 직접적인 적용에 의해 단백질의 단기 녹다운에 사용될 수 있으며, shRNA는 RNAI 경로를 통해 장기 단백질 녹다운에 사용될 수있다. 따라서 이것은 siRNA와 shRNA의 또 다른 차이점입니다.

결론

siRNA 또는 작은 간섭 RNA는 RNA 간섭 경로에서 표적 mRNA의 서열 특이 적 분해에 관여하는 비 코딩, 조절 RNA의 유형입니다. 표적과 RNA 이중을 형성하는 짧은 RNA 분자입니다. 또한, 그것은 miRNA의 내인성 처리에 의해 발생한다. 대조적으로, shRNA 또는 짧은 헤어핀 RNA는 miRNA를 모방하는 인공 RNA의 유형이다. miRNA의 분해에 의해 사용되는 동일한 세포 메커니즘에 의해 siRNA로 분해된다. 일반적으로, shRNA는 siRNA보다 길고 머리핀 루프를 함유한다. 그러나, siRNA와 shRNA의 주요 차이점은 RNAI에서 표적 mRNA의 서열 특이 적 분해 방법이다.