DNA 결합 도메인 :
전사 인자는 특정 DNA 서열을 인식 할 수있는 DNA- 결합 도메인을 함유한다. 이들 도메인은 다른 전사 인자 패밀리마다 다르며 징크 핑거, 나선 회전-헬릭스 또는 류신 지퍼와 같은 다양한 구조적 모티프를 나타낸다.
시퀀스 특이성 :
각각의 DNA- 결합 도메인은 서열 특이성을 가지며, 전사 인자가 상이한 DNA 서열에 다양한 친화 도와 결합 할 수있게한다. DNA 서열의 인식은 결합 도메인 내 아미노산 잔기 및 DNA 뉴클레오티드 사이의 수소 결합, 반 데르 발스 힘 및 정전기 접촉과 같은 염기-특이 적 상호 작용에 의존한다.
협력 적 바인딩 :
전사 인자는 종종 DNA에 대한 그들의 결합의 특이성과 친화력을 향상시키기 위해 협력 적으로 작용한다. 이 협력 결합은 전사 인자들 사이의 단백질-단백질 상호 작용을 포함하여, DNA 서열의 클러스터에 대한 결합을 안정화시키는 다 단백질 복합체의 형성을 가능하게한다.
단백질 -DNA 상호 작용 :
DNA에 대한 전사 인자의 결합은 DNA 서열의 조성, DNA- 결합 도메인의 구조, DNA 메틸화 패턴, 히스톤 변형 및 다른 DNA- 결합 단백질과의 경쟁을 포함한 다양한 인자에 의해 영향을 받는다.
전사 인자 스캐닝 :
전사 인자는 DNA 분자를 따라 슬라이딩 또는 호핑하여 DNA를 스캔하여 표적 서열을 검색합니다. 이 과정은 DNA의 3 차원 구조와 결합 부위의 접근성에 의해 영향을받습니다.
규제 지역 :
전사 인자에 의해 인식되는 DNA 서열의 클러스터는 종종 프로모터, 인핸서 및 억제제와 같은 유전자의 조절 영역에서 발견된다. 이들 영역은 전사 시작 부위 근처에 위치하고 있으며 유전자 발현을 제어하는 데 중요한 역할을한다.
컨텍스트 의존적 결합 :
DNA 서열에 대한 전사 인자의 인식 및 결합은 주변 DNA 컨텍스트에 의해 영향을받을 수있다. 이는 결합의 특이성 및 친화력이 근처의 조절 요소 또는 추가 전사 인자의 존재에 의존 할 수 있음을 의미한다.
동적 결합 :
DNA에 대한 전사 인자의 결합은 성장 인자, 호르몬 및 환경 신호를 포함한 다양한 세포 신호에 의해 조절 될 수있는 역동적 인 과정이다. 이것은 변화하는 세포 조건에 반응하여 유전자 발현의 빠른 변화를 허용한다.
전반적으로, 전사 인자는 DNA- 결합 도메인, 협력 상호 작용, 스캐닝 및 컨텍스트-의존적 결합을 포함하는 복잡한 분자 메커니즘을 통해 특정 DNA 서열의 클러스터를 발견하고 인식한다. 이는 전사 인자가 인식하고 결합하는 DNA 서열에 기초하여 특정 유전자의 전사를 선택적으로 조절함으로써 유전자 발현을 제어 할 수있게한다.