단백질은 많은 생물학적 과정에서 중요한 역할을하는 큰 분자입니다. 그들은 화학 반응을 촉진하는 효소 역할을 할 수 있습니다. 특정 분자에 결합하고 세포 반응을 유발하는 수용체; 및 세포막을 가로 질러 분자를 움직이는 수송 체. 약물은 종종 단백질에 결합하고 기능을 방해하여 작용합니다.
그러나 약물이 단백질과 어떻게 상호 작용하는지 예측하기가 어려울 수 있습니다. 단백질은 많은 다른 결합 부위를 가진 복잡한 분자이기 때문입니다. 약물의 단백질에 대한 결합의 강도는 약물의 화학적 구조, 단백질의 구조 및 상호 작용이 일어나는 환경에 따라 다릅니다.
UCSD 연구원들이 개발 한 AFE 방법은 계산 및 실험 기술의 조합을 사용하여 이러한 과제를 해결합니다. 이 방법의 계산 성분은 분자 역학 시뮬레이션을 사용하여 약물과 단백질 사이의 자유 결합 에너지를 계산합니다. 이 방법의 실험 성분은 "형광 이방성"이라는 기술을 사용하여 약물과 단백질 사이의 결합 친화도를 측정합니다.
AFE 방법은 단백질이 유연하고 다수의 결합 부위를 갖는 경우에도 단백질에 대한 약물의 결합 친화력을 정확하게 계산할 수있다. 이것은이 방법을 약물 발견을위한 귀중한 도구로 만듭니다.
UCSD의 화학 및 생화학 교수이자 연구의 선임 저자 인 Rommie Amaro는“우리의 방법은 과학자들이 더 효과적이고 부작용이 적은 신약을 설계하는 데 도움이 될 수있다. "우리는 암, 알츠하이머 및 HIV와 같은 질병에 대한 새로운 요법을 개발하는 데 어떻게 우리의 방법이 사용될 것인지를 알게되어 기쁩니다."
이 연구는 자연 방법 저널에 발표되었습니다.
