1. 단백질 :
* 아미노산 서열 : 상 동성 단백질의 아미노산 서열 (공유 조상과 단백질)을 비교하면 진화 관계를 나타낼 수 있습니다. 이것은 돌연변이가 시간이 지남에 따라 축적되어 종들 사이의 아미노산 서열의 차이를 초래하기 때문이다.
* 단백질 구조 : 단백질의 3 차원 구조는 또한 유익 할 수 있습니다. 유사한 단백질 구조는 종종 공유 진화 역사를 반영합니다.
2. 탄수화물 :
* 다당류 구조 : 단백질이나 DNA보다 일반적으로 사용되지 않지만, 복합 탄수화물 (세포벽에서 발견 된 것과 같은)의 구조는 특히 밀접하게 관련된 종 간의 관계를 연구하는 데 유익 할 수 있습니다.
3. 지질 :
* 지방산 조성 : 막 내 지방산의 조성은 특히 박테리아와 고고의 진화 관계를 연구하는 데 사용될 수 있습니다.
4. 대사 산물 :
* 대사 경로 : 신진 대사에 관여하는 효소와 경로를 비교하면 진화 적 연결을 드러 낼 수 있습니다. 유사한 대사 경로를 가진 유기체는 더 밀접한 관련이있을 수 있습니다.
5. 소분자 :
* 2 차 대사 산물 : 이들은 필수 대사 과정에 직접 관여하지 않고 종종 방어, 신호 또는 기타 기능에서 역할을하는 유기체에 의해 생성 된 소분자입니다. 특정 2 차 대사 산물의 존재 또는 부재는 관계를 유추하는 데 사용될 수 있습니다.
고려해야 할 요소 :
* 진화율 : 다른 분자는 다른 속도로 진화합니다. 예를 들어, DNA는 비교적 느리게 진화하는 반면 단백질은 더 빨리 진화 할 수 있습니다. 분자의 선택은 조사중인 진화 관계의 시간 규모에 적합해야한다.
* 데이터 가용성 : 해당 분자에 대한 서열 또는 구조 데이터의 가용성은 분석에 필수적이다.
* 상 동성 : 비교되는 분자가 진정으로 상 동성인지 확인하는 것은 정확한 진화론 적 추론에 중요합니다.
다른 분자 데이터 소스의 조합을 사용하면 진화 관계에 대한 가장 강력하고 포괄적 인 이해가 제공됩니다. Phylogenomics 로 알려진이 접근법 , 각 유형의 분자의 강도를 활용하여보다 정확하고 상세한 진화 나무를 만듭니다.
