RNA 폴리머 라제의 유형 및 프로모터
RNA 폴리머 라제는 DNA를 RNA로 전사하는 것을 담당하는 효소이다. 상이한 유형의 RNA 폴리머 라제는 진핵 생물 및 원핵 생물에 존재하며, 각각의 특정 기능 및 프로모터 인식 서열을 갖는다.
원핵 생물 :
* RNA 폴리머 라제 (RNAP) :원핵 생물 중 단일 RNA 폴리머 라제는 모든 유형의 RNA (mRNA, TRNA, RRNA)를 전사합니다.
* 프로모터 구조 :
* -10 요소 (Pribnow Box) : Tataat 서열은 전사 시작 부위로부터 상류로 약 10 개의 염기 쌍을 위치시킨다.
* -35 요소 : TTGACA 서열은 전사 시작 부위로부터 상류로 약 35 개의 염기 쌍을 위치시킨다.
* 업스트림 요소 : 일부 프로모터는 추가적인 상류로, 전사 효율에 영향을 미칩니다.
진핵 생물 :
* RNA 폴리머 라제 I (pol I) : 리보솜 RNA (RRNA) 유전자를 전사하는 책임.
* 프로모터 구조 :
* 코어 프로모터 : 코어 요소 및 업스트림 제어 요소 (UCE)를 포함하는 영역.
* 코어 요소 : 전사 시작 부위의 약 40 bp 상류에 위치한 짧은 서열.
* uce : 전사 시작 부위의 약 100 bp 상류에 위치한 영역은 종종 "업스트림 요소"(UE)라는 보존 된 서열을 포함한다.
* RNA 폴리머 라제 II (Pol II) : 단백질-코딩 유전자 (mRNA) 및 일부 작은 핵 RNA (snRNA) 유전자를 전사합니다.
* 프로모터 구조 :
* 코어 프로모터 : 일반적으로 다음 요소를 포함합니다.
* 타타 박스 : 전사 시작 부위의 상류에 약 25-30 bp에 위치한 보존 된 서열.
* 개시 자 (INR) : 전사 시작 부위 주변에 위치한 서열.
* 다운 스트림 프로모터 요소 (DPE) : 전사 시작 부위의 다운 스트림에 위치합니다.
* bre (tfiib 인식 요소) : 전사 인자 IIB (TFIIB)에 의해 인식되는 Tata 박스의 상류에 위치한 서열.
* 업스트림 규제 요소 : 이러한 요소는 코어 프로모터의 상류로 수백 또는 수천 개의베이스 쌍을 위치시킬 수 있으며 전사 속도에 영향을 줄 수 있습니다. 예제는 다음과 같습니다.
* Caat Box : 전사 인자에 결합하는 합의 서열.
* GC Box : 전사 인자에 의해 인식되는 GC- 풍부 서열.
* 강화제 : 종종 코어 프로모터에서 멀리 떨어진 전사를 자극 할 수있는 DNA 서열.
* RNA 폴리머 라제 III (Pol III) : 전이 RNA (TRNA), 5S 리보솜 RNA (5S rRNA) 및 일부 작은 핵 RNA (snRNA) 유전자를 전사합니다.
* 프로모터 구조 :
* 내부 프로모터 : TRNA 및 5S rRNA 유전자에 대한 전사 영역 내에 위치합니다.
* 업스트림 프로모터 : 일부 snRNA 유전자에 대해 전사 된 영역의 상류에 위치합니다.
요약 표 :
| RNA 폴리머 라제 | 사본 | 발기인 |
| --- | --- | --- |
| 원핵 생물 rnap | mRNA, trna, rRNA | -10 요소, -35 요소, 업스트림 요소 |
| 진핵 생물 pol i | RRNA | 코어 프로모터, UCE |
| 진핵 생물 pol II | mRNA, 일부 snrna | 코어 프로모터 (Tata Box, INR, DPE, BRE), 상류 조절 요소 |
| 진핵 생물 pol III | trna, 5s rrna, 일부 snrna | 내부 프로모터 (TRNA, 5S RRNA), 상류 프로모터 (일부 snRNA의 경우) |
이 표는 각기 다른 유형의 프로모터와 그 규제 요소가 각 그룹 내에 존재하기 때문에 철저하지 않습니다. 프로모터의 특정 서열 및 구조는 전사의 효율 및 조절에 영향을 미치며, 전사의 효율에 영향을 줄 수있다.
