* 인식 사이트 수정 : 제한 효소는 종종 인식 부위라고하는 특정한 짧은 DNA 서열을 인식합니다. 이 사이트는 일반적으로 길이가 4-8 기본 쌍입니다. 자기 복종을 방지하기 위해 박테리아 DNA (제한 효소가 유래)에는 내장 방어 메커니즘이 있습니다. 이들 DNA 서열은 다른 효소에 의해 화학적으로 변형되었다 (일반적으로 메틸화에 의해). 이 변형은 제한 효소에서 인식 사이트를 "숨기고"결합 및 절단을 방지합니다.
* 메틸화 : 메틸화는 DNA 서열의 염기에 메틸기 (CH3)를 첨가하는 과정이다. 이 변형은 DNA의 형태를 변경하고 제한 효소에 인식 할 수 없게 만듭니다.
* 특이성과 보호 : 각각의 제한 효소에는 특정 인식 서열이 있으며, 그 수정 시스템은 일치하도록 조정된다. 이것은 효소가 자신의 DNA를 그대로 유지하면서 외래 DNA (보통 메틸화되지 않은)를 자르도록합니다.
요약 : 제한 효소가 자신의 DNA를 절단 할 수 없다는 것은 아닙니다. 그들의 숙주 세포는 그들이 생산하는 효소로부터 자신의 DNA를 보호하기 위해 진화 된 메커니즘 (주로 메틸화)을 가지고 있다는 것입니다. 이것은 제한 효소가 숙주 자신의 유전자 물질에 해를 끼치 지 않고 침입 바이러스 또는 다른 외래 DNA를 효과적으로 방어 할 수 있도록한다.