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Phylotype 란 무엇입니까?

A phylotype 분류 단위 입니다 분자 데이터에 의해 정의됩니다 , 특히 DNA 서열. 그것은 유전 적 유사성을 기반으로 유기체를 그룹화하는 방법이며, 종종 16S rRNA 유전자와 같은 특정 유전자에 중점을 둡니다 박테리아에서.

다음은 Phylotype을 만드는 것의 고장입니다.

* DNA 서열에 기초한 : 계통형은 특정 유전자 또는 유전자 영역의 독특한 서열에 의해 정의되며, 일반적으로 서열이 동일한 계통형으로 간주되어야하는지에 대한 특정 임계 값을 갖는다.

* 반드시 종일 필요는 없습니다 : 계통형은 알려진 종에 해당 할 수 있지만, 공식적으로 종으로 분류되지 않은 밀접하게 관련된 유기체 그룹을 나타낼 수 있습니다.

* 미생물 공동체 연구에 유용한 : 계통 형은 다양한 미생물로 인해 전통적인 분류 학적 방법이 적용하기가 어렵거나 불가능한 미생물 공동체를 연구하는 데 특히 중요합니다.

다음은 phylotypes에 대한 몇 가지 핵심 사항입니다 :

* 그들은 운영 분류 단위 (OTU) :입니다 Phylotypes는 종종 "Operational Dexonomic Unit"(OTU)라는 용어와 상호 교환 적으로 사용되며, 이는 분석을위한 별개의 단위로 간주되는 모든 유기체 그룹을 나타냅니다.

* 그들은 다른 분류 학적 수준에서 정의 될 수 있습니다 : 계통형은 선택된 유전자 및 서열 유사성 임계 값에 따라 종, 속 또는보다 구체적인 분류 학적 그룹을 나타낼 수있다.

* 그들은 역동적입니다 : 더 많은 서열 데이터가 이용 가능 해지고 미생물 다양성에 대한 이해가 진화함에 따라 계통형 정의를 수정할 수 있습니다.

요약 : Phylotypes는 미생물 다양성과 진화를 이해하기위한 강력한 도구입니다. 그들은 전통적인 분류 학적 방법이 실현되지 않는 경우에도 연구원들이 유전자 관계에 기초하여 유기체를 그룹화 할 수있게한다. 이것은 개별 종을 식별하고 분류하는 것이 도전이 될 수있는 미생물 공동체 연구에서 특히 중요합니다.

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