1. 재조합 빈도 :
* 원리 : 감수 분열 동안 두 유전자 사이의 재조합 빈도는 그들 사이의 거리에 직접 비례합니다. 유전자가 멀어 질수록 교차하여 분리 될 가능성이 높습니다.
* 방법 :
* 해당 두 유전자에 대해 대립 유전자가 다른 개인 간의 십자가에서 자손을 분석하십시오.
* 재조합 유전자형 (부모와 대립 유전자의 다른 조합)이있는 자손의 백분율을 계산하십시오.
* 재조합 주파수를 MAP 장치 (Centimorgans, CM)로 변환합니다. 여기서 1cm는 1% 재조합 주파수를 나타냅니다.
* 한계 : 이 방법은 상대적으로 가깝게 (일반적으로 50cm 미만) 유전자에만 효과적입니다.
2. 물리적 매핑 :
* 원리 : 이 방법은 염색체의 유전자 사이의 물리적 거리를 직접 결정하는 것을 포함합니다.
* 방법 :
* 제한 단편 길이 다형성 (RFLPS) : DNA 서열의 차이를 사용하여 특정 유전자를 추적하는 데 사용할 수있는 독특한 DNA 단편의 패턴을 만듭니다.
* DNA 시퀀싱 : DNA의 정확한 뉴클레오티드 서열을 결정하여 유전자 사이의 거리의 정확한 측정을 허용합니다.
* 클론 매핑 : 겹치는 클로닝 된 DNA 조각을 사용하여 염색체의 물리적 맵을 만듭니다.
* 장점 : 재조합 빈도보다 더 정확한 측정을 제공하며 멀리 떨어진 유전자에 사용할 수 있습니다.
* 한계 : 재조합 주파수 매핑보다 시간이 많이 걸리고 비쌀 수 있습니다.
3. 연결 불균형 (LD) :
* 원리 : 이 방법은 다른 유전자좌에서 비 랜덤 대립 유전자 연관성을 사용합니다.
* 방법 :
* 모집단의 대립 유전자 변이 패턴을 검사합니다.
* 두 유전자좌 사이의 LD가 강할수록 염색체에 가까울 가능성이 높습니다.
* 장점 : 먼 거리에서 유전자를 매핑하는 데 사용할 수 있으며 게놈 전체 데이터 세트에 적용 할 수 있습니다.
* 한계 : LD 패턴은 인구 이력 및 선택과 같은 물리적 거리 이외의 요인에 의해 영향을받을 수 있습니다.
4. 비교 유전체학 :
* 원리 : 다른 종의 게놈을 비교하여 보존 된 신테 니 (유사한 유전자 순서 및 방향)의 영역을 식별합니다.
* 방법 : 관련 유기체의 게놈을 정렬하고 비교하면 유사성의 영역을 나타내고 잠재적 인 유전자 위치를 식별 할 수 있습니다.
* 장점 : 유전자 사이의 먼 관계를 식별하는 데 사용될 수 있습니다.
* 한계 : 상이한 종에 대한 완전한 게놈 서열의 이용 가능성에 의해 제한된다.
요약하면, 과학자들은 이러한 방법의 조합을 사용하여 각 기술의 장점과 한계를 고려하여 유전자 사이의 거리를 결정합니다.
