1. 푸드 웹의 붕괴 : 단세포 유기체는 대부분의 푸드 웹의 기초를 형성합니다. 그들은 광합성 (조류와 같은) 또는 화학 합성 (예 :박테리아)을 통해 햇빛을 에너지로 전환하는 주요 생산자입니다. 그들 없이는 나머지 음식 웹에 대한 에너지 원이 없을 것입니다. 초식 동물은 먹을 것이 없어서 쇠퇴하고, 그에 대한 육식 동물은 그들에게 의존합니다. 이 계단식 효과는 궁극적으로 생물 다양성과 생태계 안정성이 크게 감소하게됩니다.
2. 영양주기의 파괴 : 단세포 유기체는 영양소 순환에 필수적입니다. 특히 박테리아는 죽은 유기체와 폐기물을 분해하는 데 중요한 역할을하여 필수 영양소를 환경으로 되돌려 놓습니다. 그들 없이는 유기물이 축적되어 식물과 다른 유기체의 성장을 방해 할 것입니다. 이것은 질소주기 및 인 사이클과 같은 중요한주기를 방해하여 영양분 불균형을 초래하고 생태계의 전반적인 건강에 영향을 미칩니다.