다음은 일반적인 DNA 시퀀싱 기술의 분류입니다.
1. Sanger 시퀀싱 (체인 종료 시퀀싱) :
* 작동 방식 : 이 방법은 Dideoxynucleotides (DDNTP)를 사용하는데, 이는 3 '하이드 록실기가 없어 DNA 합성을 종료시킨다. 각 DDNTP에는 다른 형광 염료가 표시됩니다. 이어서, 생성 된 단편은 전기 영동을 사용하여 크기에 의해 분리되고, 서열은 검출 된 형광 염료의 순서에 기초하여 판독된다.
* 장점 : 매우 정확하고 비교적 저렴하며 작은 조각을 시퀀싱하는 데 좋습니다.
* 단점 : 대규모 시퀀싱 프로젝트에는 적합하지 않은 다른 방법만큼 처리량이 아닙니다.
2. 차세대 시퀀싱 (NGS) :
* 작동 방식 : 이 우산 용어는 동시에 수백만 또는 수십억의 DNA 단편을 시퀀싱하는 다양한 고 처리량 기술을 포함합니다. 일반적인 NGS 방법에는 일루미나 시퀀싱, 이온 토런트 시퀀싱 및 Pacbio 시퀀싱이 포함됩니다.
* 장점 : 고 처리량, 전체 게놈, 전 사체 및 엑스트머를 시퀀싱 할 수있는 것은 유전자 변이 및 질병에 대한 통찰력을 제공합니다.
* 단점 : Sanger 시퀀싱보다 더 비쌀 수 있으며 특수 장비 및 생물 정보학 전문 지식이 필요합니다.
3. 3 세대 시퀀싱 :
* 작동 방식 : 이들 기술은 PCR 증폭의 필요없이 단일 DNA 분자를 실시간으로 시퀀싱한다. 예는 옥스포드 나노 포어 시퀀싱 및 Pacbio 단일 분자 실시간 (SMRT) 시퀀싱을 포함한다.
* 장점 : 더 긴 판독 길이는 복잡한 게놈 시퀀싱에 적합한 DNA의 변형을 감지 할 수 있습니다.
* 단점 : NG보다 높은 오류율이 더 비쌀 수 있습니다.
4. 다른 시퀀싱 기술 :
* 바이 설 파이트 시퀀싱 : DNA 메틸화 패턴을 연구하는 데 사용됩니다.
* 염색질 면역 침전 시퀀싱 (ChIP-Seq) : 특정 단백질에 결합 된 DNA 영역을 확인하는 데 사용됩니다.
* RNA 시퀀싱 (RNA-Seq) : 전 사체 (세포의 모든 RNA 분자)를 분석하는 데 사용됩니다.
어떤 유형의 시퀀싱이 가장 좋습니까?
최적의 시퀀싱 방법은 특정 연구 요구, 예산 및 가용 리소스에 따라 다릅니다. 예를 들어:
* Sanger 시퀀싱 : 돌연변이를 확인하거나 특정 유전자를 시퀀싱하는 것과 같은 소규모 프로젝트에 적합합니다.
* ngs : 전체 게놈 시퀀싱 또는 전 사체 분석과 같은 대규모 시퀀싱 프로젝트에 이상적입니다.
* 3 세대 시퀀싱 : 복잡한 게놈 시퀀싱 또는 DNA 변형 검출에 유용합니다.
DNA 시퀀싱 분야는 항상 발전하고 있으며 새로운 기술과 응용 프로그램이 항상 개발되고 있음을 주목하는 것이 중요합니다.
이러한 시퀀싱 방법에 대해 더 이상 질문이 있거나 특정 응용 프로그램을보다 자세히 살펴 보려면 알려주십시오!
