상이한 종의 DNA 서열을 비교함으로써, 과학자들은 돌연변이의 수를 사용하여 그 종들이 서로 분기 된 지 계산할 수있다. 이 방법은 인간의 기원과 공룡의 멸종과 같은 많은 진화 적 사건에 사용되었습니다.
분자 시계는 종종 화석 기록과 같은 다른 데이트 방법과 함께 사용하여 진화 사건의시기를보다 정확하게 추정합니다.
가장 일반적으로 사용되는 분자 시계 중 일부는 다음과 같습니다.
- 미토콘드리아 게놈의 돌연변이 속도에 기초한 미토콘드리아 DNA 클록.
- 핵 유전자의 돌연변이 속도에 기초한 핵 DNA 클록.
- 리보솜 RNA 유전자의 돌연변이 속도에 기초한 리보솜 RNA 클록.
분자 클럭의 선택은 연구중인 특정 진화 사건과 DNA 서열 데이터의 이용 가능성에 의존한다.