광의 회절 한계보다 작은 유기체는 화합물 현미경을 사용하여 볼 수 없습니다. 회절 한계는 현미경으로 분해 될 수있는 물체의 최소 크기이며, 사용 된 빛의 파장과 대물 렌즈의 수치 조리개에 의해 결정된다. 가시광에 대한 회절 한계는 약 200 나노 미터 (NM)이며, 이는 이보다 작은 물체가 복합 현미경으로 볼 수 없음을 의미합니다. 많은 박테리아, 바이러스 및 기타 미생물은 200 nm보다 작으므로 화합물 현미경으로 볼 수 없습니다.