1. 분자 기술 :
* 직접 시퀀싱 : DNA는 환경 샘플 (토양, 물 등)에서 직접 추출하여 시퀀싱 할 수 있습니다. 이를 통해 연구원들은 실험실에서 자랄 수없는 경우에도 존재하는 종을 식별 할 수 있습니다.
* PCR (중합 효소 연쇄 반응) : 특정 DNA 서열은 PCR을 사용하여 환경 샘플로부터 증폭 될 수 있으며, 특정 박테리아의 검출 및 식별을 가능하게한다.
* Metagenomics : 환경 샘플로부터의 전체 유전자 물질 (DNA)은 시퀀싱되어 경작 할 수없는 것들을 포함하여 존재하는 모든 박테리아 종의 확인을 허용한다.
* Metatranscriptomics : 이 기술은 환경 샘플에 존재하는 RNA를 분석하여 박테리아에 의해 적극적으로 발현되는 유전자에 대한 정보를 제공하여 기능과 상호 작용에 대한 통찰력을 제공합니다.
2. 현미경 기술 :
* 현장 혼성화 (물고기) : 특정 DNA 서열에 결합하는 형광 프로브는 자연 환경 내에서 박테리아를 시각화하는 데 사용됩니다. 이 기술을 통해 연구원들은 배양 할 필요없이 특정 박테리아를 식별하고 정량화 할 수 있습니다.
* 전자 현미경 (EM) : EM은 박테리아의 고해상도 이미지를 제공하여 형태와 구조적 특징을 드러냅니다. EM은 종을 직접 식별 할 수 없지만, 외모에 따라 박테리아를 분류하는 데 도움이 될 수 있습니다.
3. 기능 분석 :
* 동위 원소 표지 : 안정적인 동위 원소 (13C 또는 15N)는 환경 샘플 내에서 박테리아의 신진 대사를 추적하는 데 사용됩니다. 이를 통해 연구원들은 배양 할 수없는 경우에도 생태계에서 박테리아의 기능적 역할을 연구 할 수 있습니다.
4. 농축 배양 :
* 특정 환경의 시뮬레이션 : 환경 조건은 실험실에서 시뮬레이션되어 특정 박테리아의 성장을 선호합니다. 이 방법은 전체 배양을 포함하지 않지만 특정 박테리아의 집단을 풍부하게 할 수있어 연구가 더 쉬워집니다.
5. 공동 문화 기술 :
* 다른 유기체로 성장 : 일부 박테리아는 다른 유기체의 존재가 자라고 요구합니다. 알려진 종과 공동 배양함으로써 연구자들은 때때로 이전에 재배 할 수없는 박테리아를 성공적으로 배양 할 수 있습니다.
이러한 방법에는 각각의 강점과 한계가 있습니다. 종종 접근법의 조합은 특정 환경에 존재하는 박테리아에 대한보다 포괄적 인 이해를 얻기 위해 사용됩니다.
