일반적인 오염 물질 :
* 단백질 :
* 출처 : 단백질은 세포에 풍부하며 종종 DNA와 밀접하게 관련되어 있습니다.
* 충격 : 단백질은 PCR (폴리머 라제 연쇄 반응) 및 시퀀싱과 같은 다운 스트림 응용을 방해하여 거짓 양성 결과, 절단 불량 또는 반응의 억제를 초래할 수 있습니다.
* RNA :
* 출처 : RNA는 또한 세포에서 발견되며 일반적으로 DNA보다 더 풍부합니다.
* 충격 : RNA는 특히 분광 광도계와 같은 기술 (핵산 함량에 기초한 흡광도를 측정)에서 DNA 정량화를 방해 할 수있다. 이것은 DNA 농도의 과대 평가로 이어질 수있다.
* 지질 :
* 출처 : 지질 (지방)은 세포막의 필수 성분입니다.
* 충격 : 지질은 에멀젼을 형성하여 용액을 흐리거나 불투명하게 만들 수 있으며, 이는 분광 광도 측정 및 기타 분석을 방해 할 수 있습니다. 또한 일부 효소 반응을 억제 할 수 있습니다.
* 탄수화물 :
* 출처 : 탄수화물은 세포, 특히 식물 조직에 존재한다.
* 충격 : 탄수화물은 DNA에 결합하여 순도에 영향을 미치고 전기 영동 동안 문제를 일으켜 다운 스트림 응용을 방해 할 수 있습니다.
* 소금 :
* 출처 : 염은 종종 DNA 추출의 용해 및 침전 단계에 사용됩니다.
* 충격 : 과도한 염은 효소 반응을 억제하여 PCR 또는 다른 민감한 분석에 문제를 일으킬 수 있습니다.
* 세제 :
* 출처 : 세제는 용해 중 세포막을 분해하는 데 사용됩니다.
* 충격 : 세제 잔류 물은 DNA 침전을 방해하여 DNA 수율이 낮아질 수 있습니다.
* 페놀/클로로포름 :
* 출처 : 이 화학 물질은 종종 다른 세포 성분으로부터 DNA를 분리하기 위해 유기 추출 방법에 사용됩니다.
* 충격 : 불완전한 제거는 다운 스트림 응용을 억제 할 수 있습니다.
순도에 영향을 미치는 요인 :
* 추출 방법 : 상이한 DNA 추출 프로토콜은 오염 물질을 제거 할 때 다양한 효율성을 갖는다.
* 샘플 유형 : 샘플의 복잡성과 구성 (혈액, 조직, 식물 재료 등)은 존재하는 오염 물질의 유형과 양에 영향을 미칩니다.
* 품질 관리 : 추출 및 저장 중에 적절한 품질 관리 조치는 순수한 DNA 샘플을 보장하는 데 도움이됩니다.
불순한 DNA의 결과 :
* 부정확 한 결과 : 오염 물질은 다운 스트림 응용 프로그램을 방해하여 데이터 분석이 잘못 될 수 있습니다.
* 효율 감소 : 불순물은 PCR, 시퀀싱 또는 제한 효소 소화와 같은 반응의 효율에 영향을 줄 수 있습니다.
* 거짓 양성 결과 : 일부 오염 물질은 DNA를 모방하여 거짓 양성 결과를 초래할 수 있습니다.
솔루션 :
* 정제 방법 : 컬럼 크로마토 그래피 또는 효소 소화와 같은 추가 정제 단계는 오염 물질을 제거하는 데 도움이 될 수 있습니다.
* 품질 관리 : DNA 순도 및 농도를 평가하기 위해 분광 광도계 또는 기타 기술을 사용하십시오.
* 최적화 : 추출 프로토콜을 개선하여 오염 물질 수준을 최소화하십시오.
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