* 단백질 : 단백질의 아미노산 서열은 주요 초점이다. 밀접하게 관련된 유기체는 매우 유사한 단백질 서열을 가질 것이며, 더 먼 관련 유기체는 더 많은 차이를 갖습니다.
* DNA : DNA의 뉴클레오티드 서열은 또한 진화 관계를 결정하는데 사용된다. 다시 말하지만, 밀접하게 관련된 유기체는 매우 유사한 DNA 서열을 가질 것이며, 더 먼 관련 유기체는 더 많은 차이를 갖습니다.
* RNA : DNA와 유사하게, RNA 서열은 특히 특정 유전자의 진화와 그의 기능을 연구하는데 관계를 확립하는데 사용된다.
* 대사 경로 : 대사 경로에 관여하는 효소 및 반응도 비교된다. 이 경로의 유사성은 공유 조상을 나타낼 수 있습니다.
이들 생체 분자를 다른 종에 비해 비교함으로써, 분석가들은 진화 관계를 재구성하고 생명의 분기 역사를 설명하는 계통 발생 나무를 만들 수있다.
예 :
* 세포 호흡에 관여하는 시토크롬 C 단백질은 광범위한 유기체에서 현저하게 일관된 유사성을 보여 주어 공통 조상을 시사합니다.
* 모든 살아있는 유기체에서 유사한 리보솜 RNA 서열의 존재는 보편적 인 조상에 대한 강력한 증거를 제공한다.
생체 분자가 두 종 사이에 비슷할수록 진화론 적으로 더 밀접하게 관련되어 있습니다. 이 원리는 생화학 적 데이터를 사용하여 지구상의 생명의 역사를 이해하는 분자 진화의 기초입니다.