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Pradimicin A가 바이러스 성 N- 글리 칸에 어떻게 결합하는지에 대한 분자 기초, 잠재적 SARS-COV-2 진입 억제제

제목 : Pradimicin A가 바이러스 성 N- 글리 칸에 어떻게 결합하는지에 대한 분자 기초, 잠재적 SARS-COV-2 진입 억제제

초록 :

SARS-Cov-2 바이러스로 인한 진행중인 Covid-19 Pandemic은 효과적인 치료 중재에 대한 긴급한 필요성을 야기했습니다. 스트렙토 마이 세스에서 분리 된 천연 생성물 인 프라 디미신 A는 바이러스 성 N- 글리 칸을 표적으로하여 SARS-COV-2를 포함한 다양한 봉투 바이러스에 대한 유망한 항 바이러스 활성을 보여 주었다. 그러나, 프라디미신 A가 N- 글리 칸과 상호 작용하고 바이러스 진입을 억제하는 방법에 대한 분자 세부 사항은 불분명하다. 우리는 분자 도킹, 분자 역학 시뮬레이션 및 SPR (Surface Plasmon Resonance) 실험을 수행하여 Pradimicin A의 분자 기반을 SARS-COV-2 N- 글리 칸에 결합시켰다. 우리의 결과 Pradimicin A는 수소 결합, 정전기 상호 작용 및 소수성 접촉을 통해 N- 글리 칸과 안정한 복합체를 형성한다는 것을 시사한다. 특히, Pradimicin의 2,6- 디아 미노 글루코스 및 3,4,6- 트리 하이드 록시 페닐 모이어 티는 N- 글리 칸에 결합하는 데 중요한 역할을한다. 또한 SPR 실험은 프라디미신 A와 N- 글리 칸 사이의 직접적인 상호 작용을 확인 하였다. 전반적으로, 우리의 연구는 Pradimicin A의 항 바이러스 활성의 기본 분자 메커니즘에 대한 통찰력을 제공하고 새로운 SARS-COV-2 진입 억제제의 개발을위한 납 화합물로서의 잠재력을 강조합니다.

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