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시아 노 박테리아 공동체의 빠른 프로파일 링

HABS (Hartful Algal Blooms)는 1600 년대 초부터 수생 생태계의 우려의 원인이 된 전 세계적으로 전 세계적으로 현상입니다. Habs는 식중독으로 인한 양식 유기체의 사망률과 독성 해산물의 노출 또는 소비로 인간 질병과 같은 대규모 경제 및 건강 영향을 미칩니다. 최근 몇 년 동안 해안 지역의 HAB는 빈도와 크기가 증가했습니다. 이것은 말레이시아, 필리핀, 태국 및 싱가포르와 같은 국가들이 빈번하게 HABS를보고 한 동남아시아 지역에서 볼 수 있습니다. Habs 종은 다이노 플라 겔 레이트에서 규조류 및 시아 노 박테리아에 이르기까지 다양한 식물 플랑크톤 그룹에 속합니다.

시아 노 박테리아 또는 청록색 조류는 해양 생태계에서 발견되는 산소 광합성 유기체 그룹입니다. anabaena 과 같은 독소 생성 속을 포함하는 약 3000 종의 시아 노 박테리아가 있습니다. , microcystis lyngbya . 이 시아 노 박테리아는 물고기 살해를 일으킨 HAB를 형성 할 수 있으며 인간 건강 및 레크리에이션 활동에 위협이됩니다. 해수에 존재하는 잠재적 인 독성 종의 시아 노 박테리아를 식별하기 위해, 우리는 먼저 이러한 유기체의 다양성을 이해해야합니다.

우리의 연구에서, 우리는 싱가포르와 Sabah, 말레이시아 코타 키나발루의 물을 조사했습니다. 지표수는 분석에 사용되었고, 온도 및 염분과 같은 관련 생태 매개 변수는 다중 매개 변수 프로브를 사용하여 기록되었다. 이것은 열대 해양 생태계에 존재하는 시아 노 박테리아의 다양성을 분석하기 위해 옥스포드 나노 포어 기술 (ONT)의 3 세대 시퀀싱 플랫폼 Minion ™을 사용한 첫 번째 연구입니다. 이 앰플 리콘 시퀀싱에 전장 16S rRNA 서열 (1502 bp)을 사용 하였다. 이 시퀀서는 실시간 시퀀싱 결과를 제공 할 수 있었고, 시퀀싱 24 시간 내에 7 개의 스테이션에서 총 40 종의 시아 노 박테리아를 확인 하였다. 알려진 독소를 생성 한 종이 포함 된 종의 약 절반은 포함 된 종을 확인했다. 또한,이 시퀀서는 현장에서 바이러스 및 박테리아와 같은 해양 유기체의 빠른 식별에 사용될 수있다. 이 시퀀서의 이식성은 HABS 모니터링과 같은 실시간 응용 프로그램에 추가로 사용할 수 있습니다.

이 연구에서, 우리는 싱가포르 북쪽의 Johor Strait (JS)이 싱가포르 남부 해협 (SS)과 비교할 때 종 풍부함이 더 높다는 것을 발견했습니다. 또한, 시아 노 박테리아 속 Spirulina는 광범위한 염분이있는 부위에서 검출되었다. Spirulina 종은 광범위한 염분에 견딜 수 있으며 Brackish에서 해양 해수에 이르는 서식지에서 생존하는 것으로 알려져 있습니다. 이 시아 노 박테리아의 존재는 그들이 분리 된 물이 가변적 인 염분을 가지며 샘플링 사이트에 존재하는 생태 매개 변수의 지표를 제공한다는 것을 시사합니다.

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시아 노 박테리아의 식별 및 특성화에 분리하고 배양하는 능력은 중요합니다. 그러나, 시아 노 박테리아의 일부 분류군은 부착 된 미생물의 존재로 인해 분리하기가 어렵다. 다른 분류군은 독특한 영양소 요구 사항으로 인해 쉽게 배양 할 수 없었거나 다른 유기체 또는 식물과 같은 거대 식물의 존재와 같은 특정 생태 학적 틈새 시장이 자라기 위해 쉽게 배양 할 수 없었습니다. 따라서 미니언 분자 시퀀싱을 사용하는 우리의 접근 방식은보다 포괄적 인 분류 학적 분석과 열대 해안에서 생물 다양성, 특히 유해한 시아 노 박테리아에 대한 이해를 높일 수 있습니다.


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