주요 차이 exome과 transcriptome 사이에는 exome이 게놈의 단백질 코딩 유전자에서 모든 엑손의 완전한 서열이며, 전 사체는 단백질 코딩 유전자로부터 유래 된 메신저 RNA 분자의 수집이다. 또한, Exome은 총 게놈 서열의 1-2%를 커버하는 반면, Transcriptome은 세포의 총 RNA의 4% 미만을 구성합니다.
exome and transcriptome은 게놈의 단백질 코딩 유전자에서 서열의 두 가지 수집입니다. 둘 다 게놈 연구 및 질병 진단에 다양한 적용을 가지고 있습니다.
주요 영역을 다루었습니다
1. exome
- 정의, 사실, 기술
2. 전 사체
- 정의, 사실, 기술
3. Exome과 Transcriptome 의 유사점은 무엇입니까?
- 일반적인 기능의 개요
4. Exome과 Transcriptome의 차이점은 무엇입니까
- 주요 차이점 비교
주요 용어
exon, exome, mRNA, 단백질 코딩 유전자, 전 사체
exome
exome은 특정 유기체의 게놈의 단백질 코딩 유전자에 엑손의 수집입니다. 게놈의 코딩 서열은 단백질 또는 RNA에 대해 코딩 될 수있는 유전자로 클러스터링된다. 원핵 생물 게놈에서, 코딩 서열은 다른 서열에 의해 중단되지 않는 반면, 진핵 생물 게놈에서, 유전자의 코딩 서열은 인트론이라는 비 코딩 서열에 의해 중단된다. 따라서 클러스터링 된 코딩 시퀀스를 엑손이라고합니다.
그림 1 :엑손과 인트론
단백질 코딩 유전자에서, RNA 폴리머 라제는 전사 동안 전구체 mRNA에 엑손뿐만 아니라 인트론을 전사합니다. 혼입 된 인트론은 다음과 같은 전사 후 변형 동안 제거된다. Exome 연구에 사용 된 주요 기술은 전체 exome 시퀀싱 (WES)입니다. WES는 표적 DNA 서열을 확인한 다음 시퀀싱에 이어 특정 게놈의 단편화 된 DNA의 혼성화에 관여한다.
전사
transcriptome은 셀에 표현 된 총 mRNA 세트입니다. 세포의 총 RNA의 4% 미만을 차지합니다. 전 사체는 프로테옴의 조성을 지정하기 때문에, 그 특정 세포의 생화학 적 용량을 결정한다. 또한, 특정 세포의 전 사체는 합성 될 수 없으며, 세포 분열 동안 부모 세포에서 항상 딸 세포에옵니다. 따라서, RNA를 생성하는 과정 인 전사는 전 사체의 유지를위한 단계이다.
그림 2 :다 능성 세포의 전 사체
반면에, 각 세포에는 종의 전체 전 사체의 생성에 대한 정보가 포함되어 있지만, 세포에서 발현 유전자는 환경 적 요인에 따라 다릅니다. 전 사체 연구에 사용 된 두 가지 주요 기술은 마이크로 어레이 및 RNA-Seq입니다.
exome과 transcriptome 사이의 유사성
- exome 및 전 사체는 게놈에서 발견되는 두 세트의 뉴클레오티드 서열이다.
- 둘 다 단백질 코딩 유전자의 정보와 관련이 있습니다.
- 그들은 엑손으로 구성되어 있습니다.
exome과 transcriptome의 차이
정의
exome은 엑손으로 구성된 게놈의 일부를 말하며, 이는 단백질 합성에 대한 정보를 코딩하는 반면, 전 사체는 유기체의 유전자에서 발현 된 모든 메신저 RNA 분자의 총계를 나타냅니다. 엑솜과 전 사체의 주요 차이점은이 정의에서 자체 설명입니다.
의 중요성
따라서 엑솜은 단백질 코딩 유전자의 총 엑손 세트이며, 전 사체는 세포에서 발현되는 총 mRNA 세트입니다.
DNA 또는 RNA
또한 exome은 DNA로 구성되어 있으며 전 사체는 RNA로 구성됩니다.
양
exome은 총 게놈의 1-2%를 나타내며 전 사체는 세포의 총 RNA의 4% 미만을 나타냅니다.
레벨
Exome과 Transcriptome의 또 다른 차이점은 엑솜이 게놈 수준에 있고 전 사체는 전사 수준에 있다는 것입니다.
기술
전체 엑솜 시퀀싱은 마이크로 어레이와 RNA-Seq가 전 사체를 결정하는 반면 엑솜을 결정하는 기술입니다.
결론
exome은 게놈의 wes에 의해 결정된 게놈의 전체 엑손 세트입니다. 따라서 Exome은 DNA 기반 개념입니다. 그러나, 전 사체는 세포의 mRNA 세트이기 때문에 RNA 기반 개념이다. Exome과 Transcriptome의 주요 차이점은 그들의 개념입니다.
참조 :
1. Warr, Amanda et al. "엑솜 시퀀싱 :현재 및 미래의 관점." G3 :유전자 | 게놈 | 유전학 5.8 (2015) :1543–1550. PMC. 편물. 2018 년 9 월 6 일. 여기에서 사용할 수 있습니다
2. 브라운 타. 게놈. 제 2 판. 옥스포드 :Wiley-Liss; 2002. 3 장, 전 사체 및 단백질체. 여기에서 사용할 수 있습니다
이미지 제공 :
1. Commons Wikimedia
2를 통한 National Human Genome Research Institute - (Public Domain)의“DNA 엑손 인트론”. Grskovic, M. 및 Ramalho-Santos, M., 다수성 전 사체 (2008 년 10 월 10 일), Stembook, ed. 줄기 세포 연구 커뮤니티, stembook, doi/10.3824/stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. -[1] DirectStembook 그림 2 다 능성 세포의 전 사체. Grskovic, M. 및 Ramalho-Santos, M., 다 능성 전 사체 (2008 년 10 월 10 일), Stembook, ed. 줄기 세포 연구 커뮤니티, stembook, doi/10.3824/stembook.1.24.1, http://www.stembook.org. Commons Wikimedia를 통해 (CC x 3.0)
