항 코돈 서열 이외에, TRNA 분자의 전체 구조는 또한 그것이 mRNA에 결합 할 수 있는지 여부를 결정하는데 역할을한다. TRNA 분자는 안티 코돈을 mRNA에 노출시키고 접근 할 수 있도록 특정 형태로 접을 수 있어야합니다. 이 형상은 TRNA 분자의 상이한 염기 사이의 상호 작용뿐만 아니라 TRNA 분자와 다른 단백질 사이의 상호 작용에 의해 결정된다.
마지막으로, mRNA에 대한 TRNA 분자의 결합은 또한 마그네슘 이온 및 GTP와 같은 다른 분자의 존재에 의해 영향을 받는다. 이 분자들은 TRNA와 mRNA 사이의 상호 작용을 안정화시키는 데 도움이되며, 올바른 TRNA 분자가 mRNA에 결합되도록 도와줍니다.