각각의 제한 효소는 특정 팔린 드로믹 서열에서 인식하고 절단된다. 예를 들어, 일반적으로 사용되는 제한 효소 Ecori는 Palindromic 서열 5'-GAATTC-3 '에 결합하고 절단한다. 두 가닥의 DNA는 Ecori 부위에서 다음과 같은 보완 서열을 가질 것이다.
상단 가닥 :5 '-... G Aattc ... =... Cttaa g ...- 3'
하단 가닥 :3 '-... C ttaa g ... =... gaattc ...- 5'
Palindrome은 보완 서열에서 분명합니다. DNA가 ecori에 의해 절단 될 때, 두 개의 끈적 끈적한 끝은 또한 palindromic 일 것이므로, 호환 된 돌출부가있는 다른 제한 조각에 대한 쉽게 결찰이 가능합니다.
또한, 일부 제한 효소는 인식 서열 내에서 DNA 가닥을 절단하는 반면, 다른 제한 효소는 몇 개의 뉴클레오티드를 부위에서 멀리 떨어 뜨린다. 이 속성은 각각 소화시 각각 무딘 끝 또는 응집력 끝 ( "끈적 끈적한 끝"이라고도 함)으로 이어집니다. 제한 효소의 팔린 드롬 인식 및 절단 패턴을 이해하는 것은 유전자 공학 및 생명 공학적 응용에서 DNA를 조작하고 분석하는 데 중요합니다.
