* 유전자의 생성물로서 단백질 : 단백질은 유전자에 의해 암호화되고, 유전자는 시간이 지남에 따라 돌연변이를 받는다. 이들 돌연변이는 단백질의 아미노산 서열을 변화시킬 수 있으며, 이는 그 구조와 기능에 영향을 줄 수있다.
* 구조적 유사성은 조상을 반영합니다. 밀접하게 관련된 종은 최근 공통 조상을 공유합니다. 이것은 단백질 코딩을 포함하여 그들의 유전자에 돌연변이가 축적 될 시간이 적었다는 것을 의미한다. 따라서, 이들의 단백질은 더 유사한 구조를 가질 가능성이있다.
* 비교 분석 : 다른 종의 단백질 구조를 비교함으로써 과학자들은 유사성과 차이를 식별 할 수 있습니다. 이러한 비교는 진화론 적 관계를 보여주고 유기체의 진화 역사를 보여주는 다이어그램 인 계통 발생적 나무를 만드는 데 도움이 될 수 있습니다.
단백질 구조를 관련성 지수로 사용하는 방법의 예 :
* 시토크롬 C : 이 단백질은 세포 호흡에 관여하며 광범위한 유기체에서 발견됩니다. 시토크롬 C의 아미노산 서열은 종마다 다르지만 전체 구조는 매우 유사합니다. 이 유사성은 시토크롬 C가 삶의 역사 초기에 진화했으며 여러 다른 계통에서 보존되어 왔음을 시사합니다.
* 헤모글로빈 : 이 단백질은 혈액에 산소를 운반하는 데 도움이됩니다. 헤모글로빈의 구조는 포유 동물에서 매우 유사하지만 다른 척추 동물에서는 약간 다릅니다. 이 차이는 다른 척추 동물 그룹 간의 진화 관계를 유추하는 데 사용될 수 있습니다.
한계 :
* 수렴 진화 : 때때로, 두 종은 유사한 환경 압력으로 인해 유사한 단백질 구조를 독립적으로 진화시킬 수 있습니다. 이것을 수렴 진화라고하며, 유사성이 공유 조상 또는 수렴 진화로 인한 것인지 결정하기가 어려울 수 있습니다.
* 진화율 : 다른 단백질은 다른 속도로 진화합니다. 일부 단백질은 다른 단백질보다 보존되어있어 시간이 지남에 따라 매우 느리게 변합니다. 이것은 매우 먼 관련이있는 종의 단백질 구조를 비교하기가 어려울 수 있습니다.
결론적으로, 한계가 있지만 단백질 구조 분석은 진화 관계를 이해하기위한 강력한 도구입니다. 단백질 구조가 두 종 사이에 비슷할수록 더 밀접하게 관련 될 가능성이 높습니다.