1. 인식 순서 :
* 특이성 : 각각의 제한 효소는 특정한 짧은 서열의 DNA 뉴클레오티드를 인식한다. 이 시퀀스는 일반적으로 길이가 4-8 기본 쌍이며 인식 시퀀스 라고합니다. 또는 제한 사이트 .
* palindromic 성격 : 많은 인식 서열은 palindromic이며, 이는 반대 DNA 가닥에서 동일한 뒤쪽과 앞쪽을 읽습니다. 예를 들어, 효소 Ecori는 서열 GAATTC를 인식합니다. 보완 가닥 (CTTAAG)에서 오른쪽에서 왼쪽으로 읽는 경우 동일합니다.
2. 절단 :
* 절단 : 제한 효소가 인식 서열을 찾으면 해당 서열 내의 특정 지점에서 DNA 분자를 절단한다.
* 끈적 끈적한 끝 vs. 무딘 끝 : 제한 효소 컷이 "끈적 끈적한 끝"또는 "무딘 끝"을 생성 할 수 있습니다.
* 끈적 끈적한 끝 : 효소는 DNA 가닥을 다른 위치에서 절단하여 동일한 효소로 절단 된 다른 DNA 분자로부터 상보적인 돌출부로 염기를 할 수있는 짧은 단일 가닥 돌출부를 남겨 둡니다. 이것은 재조합 DNA 분자를 생성하는 데 유용합니다.
* 무딘 끝 : 효소는 두 가닥의 DNA를 같은 위치에서 절단하여 돌출부를 남기지 않습니다.
요약 :
다음 요인은 제한 효소가 DNA를 줄이는 방법을 결정합니다.
* 효소의 특정 인식 서열.
* DNA 분자 내에서 그 서열의 위치.
* 효소의 특정 절단 패턴 (끈적 끈적한 끝 vs. 무딘 끝).
예 :
효소 ecori는 서열 Gaattc에서 DNA를 자르고 끈적 끈적한 끝을 생성합니다. 이것은 그것이 서열을 함유하는 임의의 DNA 분자를 절단하고, 생성 된 DNA 단편은 클로닝 또는 다른 유전자 조작에 사용될 수있는 단일 가닥 돌출부를 가질 것이다.