1. 수소 결합 : 이것은 단백질에서 가장 흔한 유형의 상호 작용입니다. 그것은 고도로 전기 음성 원자 (산소 또는 질소와 같은)와 다른 전기 음성 원자에 공유 적으로 연결된 수소 원자 사이에 발생합니다. 이러한 결합은 비교적 약하지만 풍부하여 단백질 구조 및 안정성에 크게 기여합니다.
2. 이온 상호 작용 : 이들은 반대로 하전 된 아미노산 측쇄 사이에서 발생한다. 예를 들어, 양으로 하전 된 라이신 측쇄는 음으로 하전 된 글루타메이트 측쇄와 상호 작용할 수 있습니다. 이러한 상호 작용은 수소 결합보다 강력하지만 공유 결합보다 약합니다.
3. 소수성 상호 작용 : 이들은 기술적으로 결합이 아니라 비극성 아미노산 측쇄를 모르기 위해 모여 물과의 접촉을 피하는 힘입니다. 이러한 상호 작용은 단백질 폴딩 및 단백질 도메인의 형성에 중요한 역할을한다.
이러한 상호 작용은 이황화 다리 (공유 결합)와 함께 각 단백질의 독특한 3 차원 구조를 만들어 그 기능을 결정합니다.