높은 염 농도 및 DNA 변성 동역학
높은 염 농도는 일반적으로 안정화 DNA와 은 속도가 느려 변성 동역학. 방법은 다음과 같습니다.
1. 인산염 그룹의 차폐 :
* DNA의 음으로 하전 된 포스페이트 골격은 정전기 반발이 발생하기 쉽다.
* 소금 이온, 특히 Na+ 또는 K+와 같은 양이온은 이러한 음전하를 효과적으로 보호 할 수 있습니다.
*이 차폐는 가닥 사이의 반발력을 줄여서 분리하기가 더 어려워집니다.
2. 카운터 이온 응축 :
* 소금 이온은 DNA 분자 주위에 응축되어 반대 이온 층을 형성 할 수 있습니다.
*이 반대 이온 층은 DNA의 음전하를 중화시키고 그 구조를 더 안정화시킵니다.
*이 효과는 특히 높은 염 농도에서 두드러집니다.
3. 수분 활동 :
* 높은 염 농도는 DNA 염기 사이의 수소 결합을 파괴하는 데 필수적인 물 분자의 이용 가능성을 감소시킬 수 있습니다.
*이 탈수 효과는 가닥이 분리하기가 더 어려워집니다.
4. 변성 온도 (TM)에 미치는 영향 :
* 높은 염 농도로 인한 DNA의 안정성이 증가하면 융합 온도가 높아집니다 (TM) .
* 이것은 DNA가 높은 소금의 존재 하에서 변성하기 위해 더 높은 온도를 필요로한다는 것을 의미합니다.
특정 예 :
* 염화나트륨 (NaCl) : 분자 생물학 프로토콜에서 일반적으로 사용됩니다. 고농도의 NaCl은 DNA의 TM을 크게 증가시켜 더 안정적으로 만듭니다.
* 클로라이드 마그네슘 (mgcl2) : 전하 밀도가 높고 인산염 백본과 상호 작용하는 능력으로 인해 NACL보다 훨씬 효과적입니다.
결론 :
높은 염 농도는 일반적으로 정전기 차폐, 반대 이온 응축 및 감소 된 수분 활성을 포함한 다양한 메커니즘을 통해 구조를 안정화시킴으로써 DNA 변성을 방해한다. 이 효과는 높은 염 용액에서 DNA에 대한 더 높은 용융 온도 (TM)에 반영됩니다.
참고 : 이것은 일반적인 원칙입니다. 일부 특정 이온 또는 염 혼합물은 DNA 변성 동역학에 독특한 영향을 미칠 수 있습니다. 결론을 도출하기 전에 특정 조건과 관련 문헌을 고려하는 것이 항상 중요합니다.
