생식 질 은행 ( ex situ 보존은 recalcitrant 종자의 경우 모든 작물의 유전 적 다양성을 보호하고 유지하는 데 필수적인 역할을하며 새로운 품종을 얻는 원천입니다. 이 컬렉션은 적절한 보존 및 가용성이 연구원과 육종가를위한 도구로 사용되도록 잘 특징 지어야합니다. 생식 질 은행이 크면 처리, 공간, 비용 등에 어려움이 생깁니다.
이것은 씨앗이 재평가하고 살아있는 식물로 유지되어야하는 과일 나무에 특히 중요합니다. 따라서, Cor Collection (CC)이라고 불리는 최소 수의 접근성으로 전체 은행의 유전 적 다양성을 유지하는 크기 감소 된 크기의 하위 수집을 찾는 것이 중요합니다. 이 CC는 관심의 특성에 대한 연구를 허용하고 심지어 유전자 연관 연구를 수행 할 수 있습니다.
감귤류는 전 세계에서 가장 중요한 과일 작물 중 하나입니다. 그것은 4 개의 기본 분류군, pummelo, citron, papeda 및 mandarins에 의해 형성됩니다. 만다린 원예 그룹 ( 감귤류 reticulata )는 Sweet Orange, Sour Orange, Clementine 등을 포함하여 현재 재배 된 자발적 상호 특이 적 하이브리드의 기원에 관여 한 유전자형 사이에 높은 변동성과 혼합물을 가지고 있습니다. 가장 중요한 두 개의 감귤 컬렉션 (Ivia, Spain; France, Inra/Cirad, France)의 총 167 개의 유전자형이 분자 마커 (SSR, Indel 및 SNP)로 특징 지어졌으며 18 IPGRI (International Plant Genetic Resources Institute) 설명자를 사용하여 표현형.
이 연구에서, 여러 소프트웨어 패키지 (Darwin, Powermarker 및 MSTRAT) 및 방법 (최대 길이 하위 트리, M 전략, 시뮬레이션 어닐링 및 MINSD)을 비교하여 두 가지 다른 목표를 가진 두 가지 다른 목표를 정의하고 가장 낮은 수의 샘플에 대한 최대 변동성을 유지하고 유전자 연관 연구를 허용합니다 (낮은 값 및 빠른 연결 불균형 (LD) DECAY). 점검 된 주요 매개 변수는 초기 수집, LD 수준 및 표현형 다양성 보유의 유전자 변동성 (HO 및 HE)이었다.
다윈 소프트웨어의 최대 길이 하위 트리 함수 (ML)는 만다린에서 CC를 설정하는 데 가장 적합한 방법 인 것 같습니다. 그것은 30 개의 접근만으로 대립 유전자 풍부 성의 96.82%를 유지했으며, 이는 초기 컬렉션의 크기의 17.96%를 나타냅니다. 게다가 초기 수집의 LD (r 값)를 증가시키지 않았고 표현형 변동의 대부분을 유지 했으므로 경제적으로 중요한 특성 (질병 및 해충 또는 과일 품질 매개 변수에 대한 저항)에 중점을 둔 연구에 사용될 수 있습니다.
.그러나 70 개의 액세스가있는 CC는 유전자 연관 연구에 더 도움이 될 것입니다. MlSubtree 샘플링 방법이 감귤류에 적합했기 때문에, 유전자 자원의 효율적인 관리를 용이하게하기 위해 다른 종에 적용될 수 있습니다. 마지막으로, CC를보다 역동적으로 만들기 위해 선택된 서브 세트에 다른 흥미로운 유전자형 또는 새로운 분자 마커가 포함될 수 있기 때문에 모든 CC는 주기적으로 수정되어야합니다.
.분자 및 표현형 데이터에 기초한 만다린 생식 질에 대한 코어 수집 샘플링 방법의 비교 분석은 최근 Applied Biology의 Annals Annals에 발표되었다. .
