DNA 개구부는 유명한 더블 헬릭스 사다리의 분자 "렁"이 분리 될 때 발생합니다. 이 중요한 단계는 세포가 DNA를 나누고 복구 할 수 있도록하는 많은 수명 과정의 핵심입니다.
"거친 입자"시뮬레이션으로 알려진 계산 방법을 사용하여 일본의 Riken에 본사를 둔 연구원들은 DNA Unsiping의 주요 단계 중 하나 인 "압축"이라고 불렀습니다.
Riken 학제 간 이론 및 수학적 과학 프로그램의 Masaki Susa는“우리의 모델은 Springs로 연결된 작은 구체의 줄로 DNA를, 그 주변의 물은 조밀 한 연속체로 나타납니다.
연구팀은 슈퍼 컴퓨터를 사용하여 10 억 DNA베이스 쌍 (또는 DNA 사다리의 "런그")의 움직임을 시뮬레이션했습니다. 그들은이 작은 구슬이 DNA 유연성 및 탄력성의 실험적 측정과 현저하게 일치하는 방식으로 흔들리는 것을 발견하여 그들의 방법이 DNA의 신체적 행동의 본질을 포착하고 있다는 확신을 제공합니다.
"우리의 계산은 열 운동이 DNA가 어떻게 열릴 수 있는지 자세히 보여줍니다. 개별베이스 쌍이 파손됨에 따라 다른 분자와 결합 할 준비가 된 단일 가닥 '끈적 끈적한'DNA는 DNA 처리의 근본적인 단계입니다.
압축 된 세그먼트는 물이 많은 환경에서 깃발을 흔들며 깃발처럼 흔들립니다. Susa는“이 플러터링은 DNA가 단백질 및 주변의 다른 분자와 상호 작용하는 방식이므로 DNA의 역학을 이해하는 데 필수적입니다.
"거친 입자"시뮬레이션은 비교적 빠르며, 팀은 이제이 기술을 사용하여 더 큰 DNA 조각을 연구하고 이러한 이중 가닥 분자의 완전한 개방 및 폐쇄를 시뮬레이션하고 있습니다.
이 연구는 저널 핵산 연구에 실린다.
