RNA 시퀀싱은 분자 생물학에서 널리 사용되는 기술로, 연구자들은 생물학적 샘플에서 유전자의 발현 수준을 프로파일 할 수있게한다. 그러나, RNA-Seq 데이터의 정확한 해석은 프로세스 동안 발생할 수있는 다양한 편향으로 인해 어려울 수 있습니다.
이러한 바이어스는 서열 조성 및 화학적 변형과 같은 RNA 분자의 고유 한 특성뿐만 아니라 라이브러리 제조 및 시퀀싱 방법론과 관련된 기술적 요인으로부터 비롯 될 수있다. 결과적으로, 특정 RNA 서열은 RNA-Seq 프로세스 동안 우선적으로 증폭되거나 억제 될 수 있으며, 유전자 발현 측정이 부정확하다.
이 문제를 해결하기 위해 UC San Diego의 연구원들은 여러 소스의 데이터를 통합하여 RNA 서열 편향에 대한 포괄적 인 이해를 제공하는 온라인 플랫폼 인 Orion을 개발했습니다. 이 도구를 통해 사용자는 유전자 발현 패턴에 대한 이러한 바이어스의 잠재적 영향을 탐색하고 이러한 편향에 특히 취약한 RNA 서열의 영역을 식별 할 수 있습니다.
연구원들은 건강한 암 세포와 암 세포 모두에서 RNA-Seq 데이터를 분석하여 Orion의 유용성을 입증했습니다. 그들은 오리온이 환경 조건의 돌연변이 또는 변화로 인해 편향된 RNA 서열의 영역을 효과적으로 식별 할 수 있음을 발견하여 RNA-Seq 데이터의보다 정확한 해석을 가능하게한다.
또한, Orion은 연구자들이 편견의 영향을받을 가능성이 적은 RNA 서열 영역을 제안함으로써 RNA-Seq 실험 설계를 최적화하여보다 신뢰할 수 있고 재현 가능한 유전자 발현 측정을 초래할 수 있습니다.
전반적으로, Orion Portal은 RNA-Seq를 사용하여 유전자 발현을 연구하는 연구자들에게 귀중한 자원을 제공합니다. 이 도구는 RNA 서열 바이어스의 영향에 대한 이해를 발전시키는 데 기여하며 RNA-Seq 데이터의보다 정확하고 신뢰할 수있는 분석을 허용합니다.
