알칼리성 조건 (일반적으로 pH 8.0 내지 9.5)은 DNA 분자의 분해능 및 분리를 개선하기 때문에 DNA 단편을 분리하기 위해 전기 영동에서 선호된다. 알칼리성 pH에서, 포스페이트 그룹의 탈 양성자 화로 인해 DNA 골격이 더 음전적으로 하전된다. 이 증가 된 음전하는 DNA 분자의 전기 영동 이동성을 향상시켜 크기에 따라 더 나은 분리를 허용합니다.
2. 단일 가닥 DNA :
알칼리성 조건은 이중 가닥 DNA의 단일 가닥 DNA로 변성을 촉진합니다. 단일 가닥 DNA 분자는 이중 가닥 DNA에 비해 균일 한 모양과 크기를 가지며, 이는 전기 영동 동안 분리를 용이하게한다.
3. 겔 안정성 :
알칼리성 완충제는 전기 영동에 사용되는 아가 로스 겔의 안정성에 기여한다. 아가 로스 겔은 고온에서 녹는 경향이 있으며, 알칼리성 조건은 전기 영동 실행 중에 무결성을 유지하여 겔 변형을 방지합니다.
4. 에티 디움 브로마이드 결합 :
에티 디움 브로마이드는 전기 영동 겔에서 DNA를 시각화하기 위해 일반적으로 사용되는 형광 염료입니다. 알칼리성 조건 하에서, 에티 디움 브로마이드는 단일 가닥 DNA에보다 효율적으로 결합하여 형광 강도를 향상시키고 DNA 밴드를 더 잘 보이게한다.
5. DNA 단편화 방지 :
알칼리성 조건은 DNA를 분해 할 수있는 효소 인 DNases의 활성을 최소화한다. 높은 pH는 이들 효소의 활성을 억제하여 전기 영동 동안 DNA 단편의 완전성을 보존한다.
전반적으로, 전기 영동의 알칼리성 조건은 더 나은 해상도, 향상된 DNA 분리, 겔 안정성, 개선 된 에티 디움 브로마이드 결합 및 DNA 분해에 대한 보호를 제공하여 DNA 분석 및 분리 기술에 선호되는 선택을 제공한다.
