메탄올의 분자간 결합은 수소 결합이다. 수소 결합은 고도로 전기 음성 원자 (예 :산소, 질소 또는 불소) 및 다른 전기 음성 원자에 결합되는 수소 원자 사이에서 발생하는 쌍극자-다이폴 상호 작용입니다. 메탄올의 경우, 하이드 록실 그룹의 수소 원자는 고도로 전기 음성 산소 원자에 결합하여 수소 원자에 부분 양전하를 생성한다. 이 부분 양전하는 근처의 메탄올 분자에서 다른 산소 원자에서의 부분 음전하와 상호 작용하여 수소 결합을 형성 할 수있다.