1. 수소 결합 : 가장 중요한 인자는 골격 아미드 (N-H)와 카르 보닐 (C =O) 그룹 사이의 수소 결합의 형성이다. 이러한 수소 결합은 나선을 함께 보유하는 강력한 네트워크를 만듭니다.
2. 반 데르 발스 상호 작용 : 나선 내에서 아미노산 측쇄의 밀접한 포장은 반 데르 발스 상호 작용을 통한 안정성에 기여한다. 이러한 상호 작용은 원자 주위의 전자 구름의 일시적 변동으로 인해 발생하며, 비극성 그룹 사이의 약하지만 부가적인 인력을 초래합니다.
3. 정전기 상호 작용 : 하전 된 측쇄 사이의 정전기 상호 작용은 나선 안정성에 영향을 줄 수 있습니다. 예를 들어, 양으로 하전 된 잔기와 음으로 하전 된 잔기 사이의 상호 작용은 나선을 안정화시킬 수있다.
4. 소수성 효과 : 비극성 측쇄는 주변의 물 분자에서 멀리 떨어진 나선의 내부에서 함께 클러스터링하는 경향이 있습니다. 이 소수성 효과는 나선의 전반적인 안정성에 기여합니다.
5. 프롤린 및 글리신 파괴 : 주기적 구조를 갖는 프롤린은 나선에서 규칙적인 수소 결합 패턴을 방해한다. 크기가 작은 글리신은 유연성으로 인해 나선을 방해 할 수 있습니다.
안정성에 영향을 미치는 요인 :
* 아미노산 서열 : 단백질에서 아미노산의 서열은 나선 형성 및 안정성에 상당히 영향을 미친다. 특정 아미노산은 다른 아미노산보다 나선 형성이 발생하기 쉽습니다.
* 용매 조건 : 특정 용매 또는 이온의 존재는 수소 결합을 방해하고 나선 안정성에 영향을 줄 수 있습니다.
* 온도 : 온도가 증가하면 수소 결합 및 기타 상호 작용을 방해하여 나선이 전개 될 수 있습니다.
전반적으로, 알파-헬릭스의 안정성은 다양한 요인의 복잡한 상호 작용입니다. 수소 결합은 중요한 역할을하는 반면, 반 데르 발스 힘, 정전기 상호 작용 및 소수성 효과와 같은 다른 상호 작용은 크게 기여합니다. 특정 아미노산 서열 및 환경 조건은 또한 알파-헬릭스의 안정성에 영향을 미칩니다.
